RNA–Protein interactions for RNA: YBL005W

PDR3, Transcript of Transcriptional activator of the pleiotropic drug resistance network, yeast

Gene PDR3, Length 2,931 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR3	YBL005W	TFB4	Q12004	338 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	DCS2	Q12123	353 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	YRR1	Q12172	810 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	CDC6	P09119	513 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PPH22	P23595	377 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	TFB1	P32776	642 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PIH1	P38768	344 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	OSW5	P40219	148 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	AIM23	P47015	356 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	YDL206W	Q12424	762 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	STB3	Q12427	513 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	HIR1	P32479	840 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SGE1	P33335	543 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	TBS1	P38114	1094 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	DMA1	P38823	416 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	FHL1	P39521	936 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SAD1	P43589	448 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	ORC5	P50874	479 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	GUP1	P53154	560 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	ERV41	Q04651	352 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	ZPS1	Q12512	249 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	GAC1	P28006	793 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	DSE1	P40077	573 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	WAR1	Q03631	944 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	AIM32	Q04689	311 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	HRT3	Q12347	344 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	NDJ1	Q12366	352 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PTC5	Q12511	572 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	KIN3	P22209	435 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	MSH2	P25847	964 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SLX8	P40072	274 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	TOF1	P53840	1238 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	COG4	Q06096	861 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	FMP25	Q08023	583 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	YPR027C	Q12079	277 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	KIP1	P28742	1111 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SWE1	P32944	819 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	GIP1	P38229	639 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	HEM14	P40012	539 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	RSM25	P40496	264 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	TIM8	P57744	87 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	HER2	Q03557	464 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PRM6	Q04705	352 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	ADY4	Q05955	493 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SPO21	Q12411	609 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	TAF13	P11747	167 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PRR1	P28708	518 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SWI3	P32591	825 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.72	□□□□□ -1.97	not detected
PDR3	YBL005W	FUI1	P38196	639 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SAK1	P38990	1142 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	PIK1	P39104	1066 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	GDH3	P39708	457 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	RMD8	P43620	662 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	GUF1	P46943	645 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	CTF18	P49956	741 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	NMA2	P53204	395 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	YNR065C	P53751	1116 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	SEG1	Q04279	960 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PDR3	YBL005W	GAL10	P04397	699 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	CIT2	P08679	460 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	SIR1	P21691	654 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	RFC5	P38251	354 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	NPR3	P38742	1146 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	TPO2	P53283	614 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	YNL108C	P53929	270 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	YPL062W	Q02781	134 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	NBP2	Q12163	236 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	FRE1	P32791	686 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PDR3	YBL005W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98

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