RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638959.1

LMBR1-222, Transcript of limb development membrane protein 1, human

TSL 5 BASIC

Gene LMBR1, Length 93 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMBR1-222	ENST00000638959	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	NFIB	O00712	420 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	CDC27	P30260	824 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	INPP5B	P32019	993 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	ARSD	P51689	593 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	GGN	Q86UU5	652 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	BCS1L	Q9Y276	419 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	C1QTNF9	P0C862	333 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	FUT4	P22083	530 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	NLRP12	P59046	1061 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	VAC14	Q08AM6	782 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	KCNMB1	Q16558	191 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	CEP135	Q66GS9	1140 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	FAM177B	A6PVY3	158 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	MMP20	O60882	483 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	USP11	P51784	963 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	BNIP3	Q12983	259 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LMBR1-222	ENST00000638959	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	PIK3CD	O00329	1044 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SYN1	P17600	705 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	EPHA1	P21709	976 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SOX18	P35713	384 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	ATP11A	P98196	1134 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CYP27A1	Q02318	531 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SEMA3F	Q13275	785 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	NCOA4	Q13772	614 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	BANK1	Q8NDB2	785 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	MISP3	Q96FF7	219 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	BORCS6	Q96GS4	357 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		3.4	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	C21orf2	O43822	256 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	XYLB	O75191	536 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	IGHA2	P01877	340 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CD8B	P10966	210 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	RASA1	P20936	1047 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	KLK14	Q9P0G3	267 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	USP20	Q9Y2K6	914 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SUV39H1	O43463	412 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	KRTAP10-2	P60368	255 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	IRF5	Q13568	498 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CCDC102B	Q68D86	513 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	GATA6	Q92908	595 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SPACA7	Q96KW9	195 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SNRK	Q9NRH2	765 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	TIAF1	O95411	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	EGFR	P00533	1210 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	KRT1	P04264	644 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CD96	P40200	585 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CABP4	P57796	275 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	PIP4K2B	P78356	416 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	KCNA10	Q16322	511 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	ZMYND15	Q9H091	742 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	GOPC	Q9HD26	462 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LMBR1-222	ENST00000638959		H3BRJ5	948 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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