RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SOX18	P35713	384 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MPP2	Q14168	576 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PDPK1	O15530	556 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TSPAN6	O43657	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CLSTN1	O94985	981 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ADH1A	P07327	375 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CENPC	Q03188	943 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	IL21	Q9HBE4	155 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163		A0A1W2PP55	124 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MAFG	O15525	162 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	APBA3	O96018	575 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	IRS1	P35568	1242 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	DHCR24	Q15392	516 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	EFS	O43281	561 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	BPI	P17213	487 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MAPK8	P45983	427 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PTGIR	P43119	386 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	KIF2C	Q99661	725 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ABCC9	O60706	1549 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	EXOC5	O00471	708 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PRC1	O43663	620 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP4A	P20648	1035 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ENC1	O14682	589 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	WNT7A	O00755	349 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	ABLIM3	O94929	683 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UBXN4-208	ENST00000490163	IMPDH2	P12268	514 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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