RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 CUL4AQ13619 759 aa15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS53Q5VIR6 699 aa15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDRG1Q9NUG6 133 aa15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 DOCK2Q92608 1830 aa15.58■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NPHP1O15259 732 aa15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZAP70P43403 619 aa15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKRD1Q15327 319 aa15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 RUFY3Q7L099 469 aa15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTC14Q96N46 770 aa15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NLRP3Q96P20 1036 aa15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CARMIL3Q8ND23 1372 aa15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MCM4P33991 863 aa15.56■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC102BQ68D86 513 aa15.56■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.56■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 APPBP2Q92624 585 aa15.56■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa15.56■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAST3O60307 1309 aa15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 PHF14O94880 888 aa15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MCAMP43121 646 aa15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 AK2P54819 239 aa15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHRNDQ07001 517 aa15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 WASHC4Q2M389 1173 aa15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 POTEAQ6S8J7 498 aa15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 LAMA4Q16363 1823 aa15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.54■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 PHKA1P46020 1223 aa15.53■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE4AQ14139 1066 aa15.53■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCARF1Q14162 830 aa15.53■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.53■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TAF1P21675 1872 aa15.52■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM37O94972 964 aa15.52■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPS6KB1P23443 525 aa15.52■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPATA5Q8NB90 893 aa15.52■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.52■□□□□ 0.08
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 M0R2C6 588 aa15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADD2P35612 726 aa15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAP3K12Q12852 859 aa15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBE3CQ15386 1083 aa15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 CNBD1Q8NA66 436 aa15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 NEK1Q96PY6 1258 aa15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.51■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 IDH1O75874 414 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMIM5Q71RC9 77 aa15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 OSBP2Q969R2 916 aa15.5■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 ST5P78524 1137 aa15.49■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 NFIXQ14938 502 aa15.49■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.49■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 PI16Q6UXB8 463 aa15.49■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.49■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 COL4A1P02462 1669 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHGBP05060 677 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 CYP21A2P08686 494 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 CPA1P15085 419 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDE6AP16499 860 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 RASGRF1Q13972 1273 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 TXNRD1Q16881 649 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS37DQ86XT2 251 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.48■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF532Q9HCE3 1301 aa15.47■□□□□ 0.07
NME1-NME2-201ENST00000376392 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms