RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262305.8

RAB11FIP3-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP3, Length 4,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-201ENST00000262305 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SGSM2O43147 1006 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 A1BGP04217 495 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 VPS36Q86VN1 386 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 IL17REQ8NFR9 667 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.613e-8■□□□□ 9.7
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPTLC2O15270 562 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.615e-7■■□□□ 11.9
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 METP08581 1390 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ITGA6P23229 1130 aa25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CCDC66A2RUB6 948 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SYT1P21579 422 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LEKR1Q6ZMV7 388 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RTL9Q8NET4 1388 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PREX2Q70Z35 1606 aa25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RMND1Q9NWS8 449 aa25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PLCG2P16885 1265 aa25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GBP3Q9H0R5 595 aa25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRIM75PA6NK02 468 aa25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PDE8AO60658 829 aa25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CPA1P15085 419 aa25.08■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRAF1Q13077 416 aa25.08■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.08■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CASQ1P31415 396 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BRAPQ7Z569 592 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SLAIN2Q9P270 581 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RPS6KB1P23443 525 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SYNMO15061 1565 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CALML3P27482 149 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 F8W031 263 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SLC27A2O14975 620 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MBD4O95243 580 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 POTEJP0CG39 1038 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 APPBP2Q92624 585 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 USP44Q9H0E7 712 aa25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MYO1BO43795 1136 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 XAGE2Q96GT9 111 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 N4BP3O15049 544 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ATP7BP35670 1465 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GNPATO15228 680 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ATL3Q6DD88 541 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 AFMP43652 599 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SSH3Q8TE77 659 aa25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 H0YHG0 523 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 UBASH3AP57075 661 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM227BQ96M60 508 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RTL1A6NKG5 1358 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRIM47Q96LD4 638 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPAG1Q07617 926 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 STAT6P42226 847 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NAPAP54920 295 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 EXOC1Q9NV70 894 aa25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TYRO3Q06418 890 aa25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PICALMQ13492 652 aa25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms