RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004430.13

Clcn3-201, Transcript of H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clcn3, Length 4,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Atp2b1G5E829 1220 aa14.69□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Diaph1O08808 1255 aa14.69□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Actn3O88990 900 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ift122Q6NWV3 1182 aa14.69□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Phldb2Q8K1N2 1249 aa14.69□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Flad1Q8R123 492 aa14.69□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa14.69□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Metap2O08663 478 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nek11Q8C0Q4 628 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 GptQ8QZR5 496 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 SdsQ8VBT2 327 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Klhl10Q9D5V2 608 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 DonsonQ9QXP4 560 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Clec11aO88200 328 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Myd88P22366 296 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gnat3Q3V3I2 354 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 March6Q6ZQ89 909 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cdca8Q8BHX3 289 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 CemipQ8BI06 1361 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa14.68□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Fez2Q6TYB5 348 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tmem87bQ8BKU8 555 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Q8BZJ8 459 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dnai2A2AC93 623 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 NapbP28663 298 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc35g1Q8BY79 368 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ankrd1Q9CR42 319 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Prdm1Q60636 856 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Necab1Q8BG18 352 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cfap45Q9D9U9 551 aa14.67□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Lrrc8aQ80WG5 810 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Krt25Q8VCW2 446 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pcdhb15Q91Y04 786 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Eva1cP58659 440 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Erich4Q3UNU4 136 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Myl10Q62082 202 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Oxsr1Q6P9R2 527 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Btn2a2A4QPC6 514 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Kcnk13Q8R1P5 405 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Cnot6lQ8VEG6 555 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa14.66□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 SympkQ80X82 1284 aa14.65□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Adora1Q60612 326 aa14.65□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Kif2aP28740 705 aa14.65□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc5a1Q8C3K6 665 aa14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ano2Q8CFW1 1002 aa14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Taf5lQ91WQ5 589 aa14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ccdc191J3QQ27 883 aa14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hspa2P17156 633 aa14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Trak2Q6P9N8 913 aa14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Amotl1Q9D4H4 968 aa14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa14.64□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Irx2P81066 474 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Sun3Q5SS91 320 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Csrnp1P59054 583 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Txndc16Q7TN22 820 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Kcnh5Q920E3 988 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ccdc83Q9D4V3 305 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Sel1lQ9Z2G6 790 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Sycp1Q62209 993 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp113Q8C689 439 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp202Q8C879 641 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Tab2Q99K90 693 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Taf7Q9R1C0 341 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ifi35Q9D8C4 286 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Abcc10Q8R4P9 1501 aa14.63□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Hap1O35668 628 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ccdc7Q9D541 371 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pus3Q9JI38 481 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Gm29094F6Q785 221 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 MthfsQ9D110 203 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Desi2Q9D291 194 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Chaf1aQ9QWF0 911 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Atp1a4Q9WV27 1032 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Pex1Q5BL07 1284 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 BrapQ99MP8 591 aa14.62□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Parp14Q2EMV9 1817 aa14.61□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Aox1O54754 1333 aa14.61□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa14.61□□□□□ -0.07
Clcn3-201ENSMUST00000004430 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.8 ms