Protein–RNA interactions for Protein: P28740

Kif2a, Kinesin-like protein KIF2A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif2aP28740 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Kif2aP28740 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Kif2aP28740 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Kif2aP28740 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Kif2aP28740 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,7■■■■□ 3,15
Kif2aP28740 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Kif2aP28740 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,57■■■■□ 3,13
Kif2aP28740 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Kif2aP28740 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Kif2aP28740 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Kif2aP28740 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Kif2aP28740 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Kif2aP28740 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Kif2aP28740 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,81
Kif2aP28740 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Kif2aP28740 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Kif2aP28740 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Kif2aP28740 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Kif2aP28740 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Kif2aP28740 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Kif2aP28740 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Kif2aP28740 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Kif2aP28740 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Kif2aP28740 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Kif2aP28740 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Kif2aP28740 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Kif2aP28740 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Kif2aP28740 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Kif2aP28740 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Kif2aP28740 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Kif2aP28740 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Kif2aP28740 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Kif2aP28740 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Kif2aP28740 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Kif2aP28740 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Kif2aP28740 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Kif2aP28740 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Kif2aP28740 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Kif2aP28740 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Kif2aP28740 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Kif2aP28740 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,47
Kif2aP28740 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Kif2aP28740 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Kif2aP28740 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,45
Kif2aP28740 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Kif2aP28740 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Kif2aP28740 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Kif2aP28740 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Kif2aP28740 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Kif2aP28740 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Kif2aP28740 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Kif2aP28740 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Kif2aP28740 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Kif2aP28740 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Kif2aP28740 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Kif2aP28740 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Kif2aP28740 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Kif2aP28740 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Kif2aP28740 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Kif2aP28740 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Kif2aP28740 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Kif2aP28740 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Kif2aP28740 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Kif2aP28740 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Kif2aP28740 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Kif2aP28740 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Kif2aP28740 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Kif2aP28740 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Kif2aP28740 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Kif2aP28740 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Kif2aP28740 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Kif2aP28740 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Kif2aP28740 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Kif2aP28740 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Kif2aP28740 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Kif2aP28740 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Kif2aP28740 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Kif2aP28740 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Kif2aP28740 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Kif2aP28740 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Kif2aP28740 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Kif2aP28740 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Kif2aP28740 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Kif2aP28740 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Kif2aP28740 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Kif2aP28740 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Kif2aP28740 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Kif2aP28740 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Kif2aP28740 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Kif2aP28740 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Kif2aP28740 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Kif2aP28740 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Kif2aP28740 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Kif2aP28740 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Kif2aP28740 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Kif2aP28740 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Kif2aP28740 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Kif2aP28740 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Kif2aP28740 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Kif2aP28740 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms