RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-208ENST00000620466 IGHV3-9P01782 118 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PTHLHP12272 177 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 NDUFB7P17568 137 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 SERPINF1P36955 418 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 MFAP5Q13361 173 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 HNF4GQ14541 408 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 GSG1Q2KHT4 349 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 MAP6Q96JE9 813 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 IDSB3KWA1 339 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 H0YIG0 161 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 MVDP53602 400 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF79Q15937 498 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 VWA2Q5GFL6 755 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ZFP82Q8N141 532 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 FGF14Q92915 247 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF75AQ96N20 296 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 LANCL2Q9NS86 450 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 OR5H14A6NHG9 310 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 C4orf47A7E2U8 309 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ADRB1P08588 477 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 P2RX3P56373 397 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 RAC1P63000 192 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ACSM1Q08AH1 577 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 NAXDQ8IW45 347 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PIGMQ9H3S5 423 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 GPANK1O95872 356 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 RPA2P15927 270 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 RAB5CP51148 216 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF85Q03923 595 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 AVPI1Q5T686 147 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 DOK3Q7L591 496 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ST7LQ8TDW4 575 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 DLL4Q9NR61 685 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PADI1Q9ULC6 663 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 TNFSF11O14788 317 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 CTSVO60911 334 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 CAPZBP47756 277 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 TLE4Q04727 773 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 OR10K2Q6IF99 312 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PELI1Q96FA3 418 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 RNF32Q9H0A6 362 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 KIAA1456Q9P272 454 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.55□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 TXNL1O43396 289 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ABHD6Q9BV23 337 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 POMT2Q9UKY4 750 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 B9D1Q9UPM9 204 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 NKX2-2O95096 273 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 OR52N5Q8NH56 324 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 EDEM2Q9BV94 578 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 PROCRQ9UNN8 238 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 SCGB1D1O95968 90 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 CHRM2P08172 466 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 HRH1P35367 487 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 SNCAP37840 140 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 ECI1P42126 302 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 HMGN3Q15651 99 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 CLLU1Q5K131 121 aa7.54□□□□□ -1.2
ALMS1-208ENST00000620466 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.54□□□□□ -1.2
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