RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 DOCK7Q96N67 2140 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 CIB4A0PJX0 185 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 CDRT1O95170 752 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 CRYGSP22914 178 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 CALRP27797 417 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 HOXC12P31275 282 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 PLP2Q04941 152 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 TBRG1Q3YBR2 411 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 TPRA1Q86W33 373 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 GABRG1Q8N1C3 465 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 OR13C5Q8NGS8 318 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF224Q9NZL3 707 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 ATMQ13315 3056 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa21.46■■□□□ 1.03
ECHDC3-201ENST00000379215 GTF3C1Q12789 2109 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 F5H5K5 113 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 CASKO14936 926 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 LY6DQ14210 128 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 INSL4Q14641 139 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 HSD17B12Q53GQ0 312 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM211Q6ICI0 200 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 C17orf78Q8N4C9 275 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 RPRMLQ8N4K4 120 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 DACH2Q96NX9 599 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC17A5Q9NRA2 495 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 TINAGQ9UJW2 476 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.45■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 CD2P06729 351 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 CD79AP11912 226 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SDC2P34741 201 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC6A9P48067 706 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 RORCP51449 518 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 C3P1Q6ZMU1 363 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 LUZP2Q86TE4 346 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 NAXEQ8NCW5 288 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 OR52H1Q8NGJ2 320 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 AKR7LQ8NHP1 331 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC25A46Q96AG3 418 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 DERL3Q96Q80 235 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 BRD7Q9NPI1 651 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 DHDHQ9UQ10 334 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 E9PLN8 166 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 HLA-HP01893 362 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 PATE4P0C8F1 98 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS19P39019 145 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 GSG1Q2KHT4 349 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 LINC00299Q6ZSB3 139 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 CROCCP3Q8IVE0 287 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF610Q8N9Z0 462 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC54Q8NEL0 328 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 FGFBP3Q8TAT2 258 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 PGAM5Q96HS1 289 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 VKORC1Q9BQB6 163 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SLITRK2Q9H156 845 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 OBP2BQ9NPH6 170 aa21.44■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 MSTNO14793 375 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 CLPXO76031 633 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 TTRP02766 147 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF12P17014 697 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 RAB1AP62820 205 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 PMPCAQ10713 525 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 GABRA6Q16445 453 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ODF4Q2M2E3 257 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 HIKESHIQ53FT3 197 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC24A3Q9HC58 644 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SNTG1Q9NSN8 517 aa21.43■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 SVILO95425 2214 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 CACNA1CQ13936 2221 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A1B0GVI7 797 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 RAD51DO75771 328 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 LYZL6O75951 148 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 LSAMPQ13449 338 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF404Q494X3 552 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM57BQ71RH2 274 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 PRSS45Q7RTY3 260 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 RDH10Q8IZV5 341 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 OR8B12Q8NGG6 310 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 OR10A2Q9H208 303 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 NOX4Q9NPH5 578 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF391Q9UJN7 358 aa21.42■■□□□ 1.02
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A0U1RQV5 110 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms