RNA–Protein interactions for RNA: YOR258W

HNT3, Transcript of DNA 5' AMP hydrolase involved in DNA repair, yeast

Gene HNT3, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HNT3	YOR258W	YJL163C	P46996	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	AMA1	P50082	593 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	THI73	Q07904	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
HNT3	YOR258W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	KIN3	P22209	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	MRC1	P25588	1096 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	NGG1	P32494	702 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
HNT3	YOR258W	PMT3	P47190	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	UME1	Q03010	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	MDM12	Q92328	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	BNR1	P40450	1375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	SEC6	P32844	805 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	SWE1	P32944	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	PET10	P36139	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	YBR053C	P38235	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	PAF1	P38351	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	TAH11	P47112	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	GPG1	P53130	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	ASI2	P53895	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	CDC9	P04819	755 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	GSY1	P23337	708 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	SAK1	P38990	1142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	ALG2	P43636	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	PEX8	P53248	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	RIA1	P53893	1110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	IRC13	Q08630	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	RAD18	P10862	487 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	MDM10	P18409	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	NRG1	Q03125	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HNT3	YOR258W	YIR042C	P40586	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SSY5	P47002	699 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	PRC1	P00729	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	DAL7	P21826	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	NIT3	P49954	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SND1	Q04007	877 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	ENV7	Q12003	364 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	YLR415C	O13578	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SRD1	P09007	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	EUG1	P32474	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SCT1	P32784	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SPC29	P33419	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SAP190	P36123	1033 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	GYP8	P43570	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	MET13	P53128	600 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	IMO32	P53219	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SLX4	Q12098	748 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	MGS1	P40151	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	YIL166C	P40445	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	COG6	P53959	839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SSL2	Q00578	843 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	RSC3	Q06639	885 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	AFT2	Q08957	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SFL1	P20134	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	YCL002C	P25565	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	PCL2	P25693	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	FLO10	P36170	1169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	YBR071W	P38243	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	PFA3	P42836	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	HFD1	Q04458	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	HOF1	Q05080	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	COQ11	Q05892	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	SGO1	Q08490	590 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	NYV1	Q12255	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	PER1	P25625	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	YJR096W	P47137	282 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	PEX14	P53112	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	DAM1	P53267	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HNT3	YOR258W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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