RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C YCR015CP25616 317 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C SUL1P38359 859 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C TDA3P38758 523 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C BFA1P47113 574 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C PMT3P47190 753 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YGR237CP50089 785 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C PCL10P53124 433 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C MRPS35P53292 345 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C TRM2P33753 639 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C MNN4P36044 1178 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YKR075CP36155 307 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YEN1P40028 759 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C MGS1P40151 587 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C COX18P53239 316 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YMR206WQ03695 313 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C DLT1Q04216 342 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C COG8Q04632 607 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C GAD1Q04792 585 aa3.3□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C ERG4P25340 473 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YKR018CP36114 725 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C APT2P36973 181 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YBR259WP38338 688 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C MIP6P38760 659 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C ELO3P40319 345 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C AIM21P40563 679 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YJR096WP47137 282 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YGR153WP48238 217 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C MUP1P50276 574 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C TGL5Q12043 749 aa3.29□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C PMI40P29952 429 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C SIC1P38634 284 aa3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C CKB2P38930 258 aa3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YLR040CQ07988 224 aa3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C GPR1Q12361 961 aa3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C TRM13Q12383 476 aa3.28□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YIR042CP40586 236 aa3.27□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C BUL1P48524 976 aa3.27□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C MSE1P48525 536 aa3.27□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C SUN4P53616 420 aa3.27□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C ARP4P80428 489 aa3.27□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C KIN4Q01919 800 aa3.27□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C RNT1Q02555 471 aa3.27□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C HFD1Q04458 532 aa3.27□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C ALG7P07286 448 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C KTR4P38131 464 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C APN2P38207 520 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YHR112CP38716 378 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YHR202WP38887 602 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C AMA1P50082 593 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YGL081WP53156 320 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C ERG5P54781 538 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C URN1Q06525 465 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YOL073CQ08232 322 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C SGO1Q08490 590 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C FRE5Q08908 694 aa3.26□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C GRX4P32642 244 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C MAL31P38156 614 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C UBP12P39538 1254 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YNL195CP40168 261 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C RET2P43621 546 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C SET2P46995 733 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C GPG1P53130 126 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C TEX1P53851 422 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C ARG5,6Q01217 863 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C IRC13Q08630 104 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C DCS2Q12123 353 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C ECM3Q99252 613 aa3.25□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C PPR1P07272 904 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C RNR1P21524 888 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YBR053CP38235 358 aa3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C GZF3P42944 551 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YJL163CP46996 555 aa3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C MTL1P53214 551 aa3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C REC102Q02721 264 aa3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YMR210WQ03649 449 aa3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YHM2Q04013 314 aa3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C MCM21Q06675 368 aa3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RPB11YOL005C PUS9Q12069 462 aa3.24□□□□□ -1.89
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