RNA–Protein interactions for RNA: YMR254C

YMR254C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YMR254C, Length 309 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR254C	YMR254C	YBP2	P53169	641 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	ASM4	Q05166	528 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	SRD1	P09007	221 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	MEF1	P25039	761 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	THI4	P32318	326 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	YKR018C	P36114	725 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	HSL7	P38274	827 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	GID8	P40208	455 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	MUK1	Q02866	612 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	GAD1	Q04792	585 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	MCM21	Q06675	368 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	IRC10	Q08118	586 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	SGO1	Q08490	590 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	SIR3	P06701	978 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	MIH1	P23748	554 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	VBA3	P25594	458 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	FMP52	P40008	231 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	SDS3	P40505	327 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	YFL052W	P43551	465 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	STU2	P46675	888 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	UBC11	P52492	156 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	NPY1	P53164	384 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	ORC4	P54791	529 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	NHX1	Q04121	633 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	CRR1	Q05790	422 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YMR254C	YMR254C	MTH1	P35198	433 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	BCD1	P38772	366 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	DSS1	P39112	969 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	YAP1802	P53309	568 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	IRC13	Q08630	104 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	TEL2	P53038	688 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	NTG2	Q08214	380 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	PCL2	P25693	308 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	HIR1	P32479	840 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	APT2	P36973	181 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	YHR112C	P38716	378 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	PCL10	P53124	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	GND2	P53319	492 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	REC102	Q02721	264 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
YMR254C	YMR254C	YKR051W	P36142	418 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	REV7	P38927	245 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	SSL2	Q00578	843 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	ATG33	Q06485	197 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	SPC42	P36094	363 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	LYS9	P38999	446 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	PCL5	P38794	229 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	NUP60	P39705	539 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	MTL1	P53214	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	ALG12	P53730	551 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YMR254C	YMR254C	RAD18	P10862	487 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	SFL1	P20134	766 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	PEX1	P24004	1043 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	YPT53	P36019	220 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	FMO1	P38866	432 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	FHN1	P53279	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	HMG1	P12683	1054 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	MGS1	P40151	587 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	RNH70	P53331	553 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	YNL193W	P53870	558 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	ARP4	P80428	489 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	TAF3	Q12297	353 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	CDC43	P18898	376 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	SEC6	P32844	805 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	APN2	P38207	520 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR254C	YMR254C	GET2	P40056	285 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.8 ms