RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	MBP1	P39678	833 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YIL165C	P40446	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	QRI7	P43122	407 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	VPS53	P47061	822 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	VTC3	Q02725	835 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SRD1	P09007	221 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	INO1	P11986	533 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CMP2	P14747	604 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	APN1	P22936	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RSC6	P25632	483 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MSH1	P25846	959 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	DOM34	P33309	386 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SLC1	P33333	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RER2	P35196	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RRF1	P38771	230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PAN5	P38787	379 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	GIP2	P40036	548 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	VHR1	P40522	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	LEM3	P42838	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PPT1	P53043	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	GUP1	P53154	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	DSE4	P53753	1117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ZDS2	P54786	942 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	EAR1	Q03212	550 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RNH1	Q04740	348 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ADY3	Q07732	790 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SPO14	P36126	1683 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MRP10	O75012	95 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YER152C	P10356	443 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	COQ2	P32378	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PAH1	P32567	862 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MTH1	P35198	433 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	AIM46	P38885	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	VPS41	P38959	992 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RTT105	P40063	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PSY2	P40164	858 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PCL7	P40186	285 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RAD26	P40352	1085 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ZIP2	P53061	704 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	AIM14	P53109	570 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SLD3	P53135	668 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YAP1802	P53309	568 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RIA1	P53893	1110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	TIM10	P87108	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ARA2	Q04212	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	TAF11	Q04226	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RAD33	Q04231	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MNE1	P24720	663 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RPC53	P25441	422 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PCL2	P25693	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SWC3	P31376	625 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YKU70	P32807	602 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CNS1	P33313	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MCD4	P36051	919 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PPE1	P38796	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	EMP65	P40085	556 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	TED1	P40533	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	AXL1	P40851	1208 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YJL181W	P46987	611 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YJL055W	P47044	245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PEX13	P80667	386 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	HDA2	Q06629	674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	YRM1	Q12340	786 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	ISA2	Q12425	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	BUD3	P25558	1636 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	BI4	P03879	638 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RED1	P14291	827 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	MET8	P15807	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	RIB7	P33312	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YRA2	YKL214C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
YRA2	YKL214C	FTH1	P38310	465 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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