RNA–Protein interactions for RNA: YHR187W

IKI1, Transcript of Subunit of hexameric RecA-like ATPase Elp456 Elongator subcomplex, yeast

Gene IKI1, Length 930 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKI1	YHR187W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	YIR042C	P40586	236 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	MRPS35	P53292	345 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	ATG33	Q06485	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	FRE5	Q08908	694 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	MUP1	P50276	574 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IKI1	YHR187W	MIH1	P23748	554 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	SLI1	P53304	468 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	GAD1	Q04792	585 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	ASM4	Q05166	528 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	ADY4	Q05955	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	TGL5	Q12043	749 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	YKR051W	P36142	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	APT2	P36973	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	YBR053C	P38235	358 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	PCL10	P53124	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	DOS2	P54858	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	DNM1	P54861	757 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	MCM21	Q06675	368 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	TRM13	Q12383	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	OAR1	P35731	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	MGS1	P40151	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	DAS1	P47005	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	AIM14	P53109	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	MET13	P53128	600 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	TIM44	Q01852	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	REC102	Q02721	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	OMS1	Q06668	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	ACF2	Q12168	779 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	HMG1	P12683	1054 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	BAP3	P41815	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	YJL163C	P46996	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	GUD1	Q07729	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	MOH1	P38191	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	GID8	P40208	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	HLJ1	P48353	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	ADR1	P07248	1323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	YHR112C	P38716	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	YHL017W	P38745	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	HOS4	P40480	1083 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	MNN4	P36044	1178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	PPS1	P38148	807 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	MAL31	P38156	614 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	REV7	P38927	245 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	FMP52	P40008	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	UBC11	P52492	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	RIA1	P53893	1110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	MCH5	Q08777	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IKI1	YHR187W	BRN1	P38170	754 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	APN2	P38207	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	BCD1	P38772	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	CKB2	P38930	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	PMT3	P47190	753 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	STB4	P50104	949 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	YAP1802	P53309	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	ARP4	P80428	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	SGO1	Q08490	590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	IRC13	Q08630	104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	YJR142W	P47173	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	UBA2	P52488	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	YGL081W	P53156	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	THI73	Q07904	523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	SPC42	P36094	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	NUP60	P39705	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	BFA1	P47113	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	MTL1	P53214	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IKI1	YHR187W	DCS2	Q12123	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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