RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	SSN3	P39073	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	RMD8	P43620	662 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SAE2	P46946	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ARH1	P48360	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MLS1	P30952	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SLA1	P32790	1244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	REC104	P33323	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ERT1	P38140	529 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	RGD1	P38339	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	AXL2	P38928	823 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	GLO4	Q12320	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	BUD3	P25558	1636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	QCR6	P00127	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CDC16	P09798	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DBF4	P32325	704 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	AFG2	P32794	780 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MTH1	P35198	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	OAF3	P36023	863 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	HSL7	P38274	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PPE1	P38796	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YHM2	Q04013	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PUS5	Q06244	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MIH1	P23748	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YCL049C	P25577	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SPC72	P39723	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ROG3	P43602	733 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ULI1	P43604	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	BNA2	P47125	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	RKM2	Q03942	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	VID22	Q05934	901 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	FUS1	P11710	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NEM1	P38757	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	LAM1	P38851	1228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PNT1	P38969	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MSN5	P52918	1224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	GUP1	P53154	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NUR1	Q12066	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
SYF1	YDR416W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SMC4	Q12267	1418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PER1	P25625	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	APM3	P38153	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ALG3	P38179	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SSN2	P38931	1420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DUN1	P39009	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CBK1	P53894	756 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	VPS9	P54787	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TFC6	Q06339	672 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CDC45	Q08032	650 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ESC8	Q08119	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MDM38	Q08179	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	GYP1	Q08484	637 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ENV7	Q12003	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ATP12	P22135	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YBR225W	P38321	900 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SAW1	P39735	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YER010C	P40011	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	IMA5	P40884	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ENV11	P53246	860 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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