RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174939.1

Snord55-201, mousemouse

BASIC

Gene Snord55, Length 79 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snord55-201ENSMUST00000174939 Nup188Q6ZQH8 1759 aa13.53□□□□□ -0.24
Snord55-201ENSMUST00000174939 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm4340L7N2C4 268 aa13.53□□□□□ -0.24
Snord55-201ENSMUST00000174939 Chrna5Q2MKA5 467 aa13.53□□□□□ -0.24
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mctp2Q5RJH2 878 aa13.53□□□□□ -0.24
Snord55-201ENSMUST00000174939 Myoz2Q9JJW5 264 aa13.53□□□□□ -0.24
Snord55-201ENSMUST00000174939 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa13.53□□□□□ -0.24
Snord55-201ENSMUST00000174939 TsksO54887 585 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Csf1rP09581 977 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sept1P42209 366 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Bend4P86174 541 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mcm2P97310 904 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 DbnlQ62418 436 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Insm1Q63ZV0 521 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Unc5clQ6R653 518 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Asap2Q7SIG6 958 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Chmp5Q9D7S9 219 aa13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Flt1P35969 1333 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Nphp3Q7TNH6 1325 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm3043K7N693 218 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm16440K7N6G6 218 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm2244L7N2A3 218 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm3278L7N2D2 218 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm8271L7N2E2 218 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Slc4a3P16283 1227 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Znf692Q3U381 531 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gpr101Q80T62 511 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ift57Q8BXG3 429 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Tmem266Q8BZB3 538 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cypt1Q8CH20 168 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Bcar3Q9QZK2 820 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa13.51□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cyp2c68K7N6C2 491 aa13.5□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Hoxa7P02830 229 aa13.5□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa13.5□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Kcnq5Q9JK45 933 aa13.5□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa13.5□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ccne2Q9Z238 404 aa13.5□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cfap44E9Q5M6 1843 aa13.49□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Vsig10D3YX43 558 aa13.49□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gpr162Q3UN16 588 aa13.49□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Zbtb45Q52KG4 520 aa13.49□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 B4galnt3Q6L8S8 986 aa13.49□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa13.49□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sptlc3Q8BG54 563 aa13.49□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Slc4a1P04919 929 aa13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rhbdl3P58873 404 aa13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Csrnp1P59054 583 aa13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam228bQ497Q6 232 aa13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fchsd1Q6PFY1 688 aa13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Riok1Q922Q2 567 aa13.48□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Setdb1O88974 1307 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Izumo3A6PWV3 263 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Hmox1P14901 289 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ccdc51Q3URS9 406 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Nlrp9aQ66X03 949 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Erc2Q6PH08 957 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Kif18aQ91WD7 886 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Taf5lQ91WQ5 589 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Supt16hQ920B9 1047 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 EvplQ9D952 2035 aa13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Map7O88735 730 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Spg7Q3ULF4 781 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Abtb2Q7TQI7 1024 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam160b2Q80YR2 744 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 WdpcpQ8C456 722 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Plekhg6Q8R0J1 787 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Krt25Q8VCW2 446 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam84aQ9D650 292 aa13.46□□□□□ -0.25
Snord55-201ENSMUST00000174939 Btaf1E9QAE3 1848 aa13.46□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ltn1Q6A009 1767 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Phrf1A6H619 1682 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ankrd63A2ARS0 390 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Zkscan2G3X952 960 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Terf1P70371 421 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Map3k9Q3U1V8 1077 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Vps54Q5SPW0 977 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Skor1Q8BX46 964 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Znf428Q8C1M2 176 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Slc51aQ8R000 340 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sgip1Q8VD37 806 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 EspnQ9ET47 871 aa13.45□□□□□ -0.26
Snord55-201ENSMUST00000174939 Letm1Q9Z2I0 738 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 783.6 ms