RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174939.1

Snord55-201, mousemouse

BASIC

Gene Snord55, Length 79 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa24■■□□□ 1,43
Snord55-201ENSMUST00000174939 NischQ80TM9 1593 aa23,93■■□□□ 1,42
Snord55-201ENSMUST00000174939 Abcc9P70170 1546 aa23,15■■□□□ 1,3
Snord55-201ENSMUST00000174939 Abcc8B2RUS7 1588 aa23,01■■□□□ 1,27
Snord55-201ENSMUST00000174939 ScribQ80U72 1612 aa21,96■■□□□ 1,11
Snord55-201ENSMUST00000174939 NacadQ5SWP3 1504 aa21,39■■□□□ 1,01
Snord55-201ENSMUST00000174939 Kdm5dQ62240 1548 aa21,35■■□□□ 1,01
Snord55-201ENSMUST00000174939 Dcaf1Q80TR8 1506 aa21,26■□□□□ 0,99
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rhox8Q6VSS7 320 aa21,17■□□□□ 0,98
Snord55-201ENSMUST00000174939 Sycp2Q9CUU3 1500 aa20,94■□□□□ 0,94
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa20,88■□□□□ 0,93
Snord55-201ENSMUST00000174939 Baz1aO88379 1555 aa20,59■□□□□ 0,89
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ccdc180J3QNE4 1664 aa20,57■□□□□ 0,88
Snord55-201ENSMUST00000174939 BicraF8VPZ9 1578 aa20,56■□□□□ 0,88
Snord55-201ENSMUST00000174939 Crybg2B7ZCC2 1516 aa20,48■□□□□ 0,87
Snord55-201ENSMUST00000174939 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP20,31■□□□□ 0,84
Snord55-201ENSMUST00000174939 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20,01■□□□□ 0,79
Snord55-201ENSMUST00000174939 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP20■□□□□ 0,79
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rtl1Q7M732 1744 aa19,96■□□□□ 0,79
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa19,86■□□□□ 0,77
Snord55-201ENSMUST00000174939 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP19,85■□□□□ 0,77
Snord55-201ENSMUST00000174939 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP19,8■□□□□ 0,76
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa19,74■□□□□ 0,75
Snord55-201ENSMUST00000174939 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa19,64■□□□□ 0,73
Snord55-201ENSMUST00000174939 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP19,61■□□□□ 0,73
Snord55-201ENSMUST00000174939 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa19,61■□□□□ 0,73
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ercc6F8VPZ5 1481 aa19,59■□□□□ 0,73
Snord55-201ENSMUST00000174939 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP19,55■□□□□ 0,72
Snord55-201ENSMUST00000174939 CftrP26361 1476 aa19,46■□□□□ 0,71
Snord55-201ENSMUST00000174939 Trim41Q5NCC3 630 aa19,45■□□□□ 0,7
Snord55-201ENSMUST00000174939 Synj1Q8CHC4 1574 aa19,44■□□□□ 0,7
Snord55-201ENSMUST00000174939 Frmpd1A2AKB4 1549 aa19,41■□□□□ 0,7
Snord55-201ENSMUST00000174939 Wdr62Q3U3T8 1523 aa19,41■□□□□ 0,7
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa19,41■□□□□ 0,7
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa19,37■□□□□ 0,69
Snord55-201ENSMUST00000174939 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP19,3■□□□□ 0,68
Snord55-201ENSMUST00000174939 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP19,27■□□□□ 0,68
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fam135aQ6NS59 1506 aa19,25■□□□□ 0,67
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ubl4bQ9CQ84 188 aa19,16■□□□□ 0,66
Snord55-201ENSMUST00000174939 Unc13aQ4KUS2 1712 aa19,08■□□□□ 0,65
Snord55-201ENSMUST00000174939 Baz1bQ9Z277 1479 aa19,03■□□□□ 0,64
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cngb1E1AZ71 1325 aa19■□□□□ 0,63
Snord55-201ENSMUST00000174939 Golga3P55937 1487 aa18,97■□□□□ 0,63
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP18,93■□□□□ 0,62
Snord55-201ENSMUST00000174939 Kif15Q6P9L6 1387 aa18,89■□□□□ 0,61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mrc2Q64449 1479 aa18,86■□□□□ 0,61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Top2bQ64511 1612 aa18,83■□□□□ 0,61
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lamc3Q9R0B6 1581 aa18,81■□□□□ 0,6
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cux2P70298 1426 aa18,79■□□□□ 0,6
Snord55-201ENSMUST00000174939 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP18,7■□□□□ 0,58
Snord55-201ENSMUST00000174939 Fmn1Q05860 1466 aa18,67■□□□□ 0,58
Snord55-201ENSMUST00000174939 TnnQ80Z71 1560 aa18,65■□□□□ 0,58
Snord55-201ENSMUST00000174939 Il27Q8K3I6 234 aa18,63■□□□□ 0,57
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ccdc18Q640L5 1455 aa18,59■□□□□ 0,57
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cep164Q5DU05 1446 aa18,58■□□□□ 0,57
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa18,53■□□□□ 0,56
Snord55-201ENSMUST00000174939 Camsap1A2AHC3 1581 aa18,51■□□□□ 0,55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Kif21aQ9QXL2 1672 aa18,5■□□□□ 0,55
Snord55-201ENSMUST00000174939 Chic1Q8CBW7 227 aa18,5■□□□□ 0,55
Snord55-201ENSMUST00000174939 HrcG5E8J6 738 aa18,48■□□□□ 0,55
Snord55-201ENSMUST00000174939 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18,44■□□□□ 0,54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP18,41■□□□□ 0,54
Snord55-201ENSMUST00000174939 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa18,39■□□□□ 0,53
Snord55-201ENSMUST00000174939 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP18,35■□□□□ 0,53
Snord55-201ENSMUST00000174939 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP18,33■□□□□ 0,53
Snord55-201ENSMUST00000174939 Grin2bQ01097 1482 aa18,31■□□□□ 0,52
Snord55-201ENSMUST00000174939 Crocc2F6XLV1 1638 aa18,29■□□□□ 0,52
Snord55-201ENSMUST00000174939 Plb1Q3TTY0 1478 aa18,27■□□□□ 0,52
Snord55-201ENSMUST00000174939 Duox2A2AQ99 1517 aa18,27■□□□□ 0,51
Snord55-201ENSMUST00000174939 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP18,26■□□□□ 0,51
Snord55-201ENSMUST00000174939 Efcab5A0JP43 1406 aa18,2■□□□□ 0,5
Snord55-201ENSMUST00000174939 NrkQ9R0G8 1455 aa18,2■□□□□ 0,5
Snord55-201ENSMUST00000174939 Gab3Q8BSM5 595 aa18,17■□□□□ 0,5
Snord55-201ENSMUST00000174939 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP18,13■□□□□ 0,49
Snord55-201ENSMUST00000174939 Ift140E9PY46 1464 aa18,13■□□□□ 0,49
Snord55-201ENSMUST00000174939 Shroom4Q1W617 1475 aa18,13■□□□□ 0,49
Snord55-201ENSMUST00000174939 Npm2Q80W85 207 aa18,12■□□□□ 0,49
Snord55-201ENSMUST00000174939 PtprkP35822 1457 aa18,11■□□□□ 0,49
Snord55-201ENSMUST00000174939 Samd9lQ69Z37 1561 aa18,08■□□□□ 0,48
Snord55-201ENSMUST00000174939 Zeb1Q64318 1117 aa18,07■□□□□ 0,48
Snord55-201ENSMUST00000174939 Disp1Q3TDN0 1521 aa18,04■□□□□ 0,48
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rad54l2Q99NG0 1466 aa18,01■□□□□ 0,47
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa17,95■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 Rusc2Q80U22 1514 aa17,95■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP17,93■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP17,93■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa17,92■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 SynmQ70IV5 1561 aa17,91■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 Grin2aP35436 1464 aa17,91■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 Magi3Q9EQJ9 1476 aa17,9■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa17,9■□□□□ 0,46
Snord55-201ENSMUST00000174939 Cep162Q6ZQ06 1403 aa17,86■□□□□ 0,45
Snord55-201ENSMUST00000174939 Arhgap35Q91YM2 1499 aa17,85■□□□□ 0,45
Snord55-201ENSMUST00000174939 Setd1bQ8CFT2 1985 aa17,84■□□□□ 0,45
Snord55-201ENSMUST00000174939 Myt1lP97500 1187 aa17,84■□□□□ 0,45
Snord55-201ENSMUST00000174939 Pla2r1Q62028 1487 aa17,83■□□□□ 0,45
Snord55-201ENSMUST00000174939 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP17,8■□□□□ 0,44
Snord55-201ENSMUST00000174939 Map3k1P53349 1493 aa17,79■□□□□ 0,44
Snord55-201ENSMUST00000174939 Carmil1Q6EDY6 1374 aa17,79■□□□□ 0,44
Snord55-201ENSMUST00000174939 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP17,75■□□□□ 0,43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,6 ms