RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 DaxxO35613 739 aa22.64■■□□□ 1.21
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mb21d2Q8C525 428 aa22.64■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kcnb2A6H8H5 907 aa22.63■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 RubcnlQ3TD16 648 aa22.63■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Polr3dQ91WD1 398 aa22.63■■□□□ 1.21
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sh3bp5Q9Z131 463 aa22.63■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Setdb1O88974 1307 aa22.63■■□□□ 1.21
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Duox1A2AQ92 1551 aa22.62■■□□□ 1.21
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nlrp9aQ66X03 949 aa22.62■■□□□ 1.21
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ube4aE9Q735 1028 aa22.61■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm4340L7N2C4 268 aa22.61■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prl3d1P18121 224 aa22.61■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kank4Q6P9J5 1016 aa22.61■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sptlc3Q8BG54 563 aa22.61■■□□□ 1.21
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Chmp4cQ9D7F7 232 aa22.6■■□□□ 1.21
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tmem143Q8VD26 458 aa22.6■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myh7Q91Z83 1935 aa22.59■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Scn11aQ9R053 1765 aa22.59■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 St18Q80TY4 1045 aa22.59■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cdca7lQ922M5 438 aa22.59■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rufy3Q9D394 469 aa22.59■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Col3a1P08121 1464 aa22.59■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zfyve9A2A8R0 1397 aa22.58■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ubn2Q80WC1 1314 aa22.58■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Il17raQ60943 864 aa22.58■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AidaQ8C4Q6 305 aa22.57■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Amhr2Q8K592 568 aa22.57■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gja10Q9WUS4 505 aa22.57■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hap1O35668 628 aa22.57■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 GabrdP22933 449 aa22.57■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map10Q8BJS7 891 aa22.56■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sugp2Q8CH09 1067 aa22.56■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pof1bQ8K4L4 587 aa22.56■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pdlim2Q8R1G6 349 aa22.56■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tktl2Q9D4D4 627 aa22.56■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gdpd2Q9ESM6 539 aa22.56■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plcb2A3KGF7 1181 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Eva1cP58659 440 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ssh1Q76I79 1042 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp44Q8C2S0 711 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lmbrd2Q8C561 694 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rassf8Q8CJ96 419 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Appbp2Q9DAX9 585 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 IncenpQ9WU62 880 aa22.55■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ddit3P35639 168 aa22.54■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nme8Q715T0 586 aa22.54■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc39a11Q8BWY7 342 aa22.54■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ubr3Q5U430 1889 aa22.54■■□□□ 1.2
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Syt1P46096 421 aa22.53■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Znf496Q5SXI5 585 aa22.53■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sp8Q8BMJ8 486 aa22.53■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Irgm2A0A140LIF8 407 aa22.52■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Arid3aQ62431 601 aa22.52■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myo3bQ1EG27 1305 aa22.52■■□□□ 1.2
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Vars2Q3U2A8 1060 aa22.51■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bag4Q8CI61 457 aa22.51■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prl7a2O54831 253 aa22.51■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Emilin1Q99K41 1017 aa22.51■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm45015A0A140LII9 184 aa22.5■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm18336A0A140LIU8 765 aa22.5■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 F2rP30558 430 aa22.5■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zdhhc9P59268 364 aa22.5■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm7347D3YYI9 267 aa22.49■■□□□ 1.19
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