RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 OR51A2Q8NGJ7 313 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 GPR78Q96P69 363 aa14.78□□□□□ -0.04
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RXRA-201ENST00000356384 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.78□□□□□ -0.04
RXRA-201ENST00000356384 OR5AS1Q8N127 324 aa14.78□□□□□ -0.04
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RXRA-201ENST00000356384 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
RXRA-201ENST00000356384 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.75□□□□□ -0.05
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RXRA-201ENST00000356384 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.75□□□□□ -0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR5B3Q8NH48 314 aa14.75□□□□□ -0.05
RXRA-201ENST00000356384 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RXRA-201ENST00000356384 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.75□□□□□ -0.05
RXRA-201ENST00000356384 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.75□□□□□ -0.05
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