RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232		H7C1C5	153 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	DCTN6	O00399	190 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	DHH	O43323	396 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CLIC3	O95833	236 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CTLA4	P16410	223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SPI1	P17947	270 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	BMP5	P22003	454 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SLC2A5	P22732	501 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MYF6	P23409	242 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MPG	P29372	298 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LCN6	P62502	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	P2RY6	Q15077	328 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	NRN1L	Q496H8	165 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232		Q9H521	79 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CRLF2	Q9HC73	371 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	B9D1	Q9UPM9	204 aa		10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FAM183A	A6NL82	134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232		M0R129	80 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SLC16A7	O60669	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79	1e-6	■■■■■ 28.6
GGA3-211	ENST00000582232	KRT33A	O76009	404 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	IGHV3-9	P01782	118 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	COX5A	P20674	150 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF84	P51523	738 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	BLVRA	P53004	296 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FMOD	Q06828	376 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	FAP	Q12884	760 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	TMED1	Q13445	227 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GID4	Q8IVV7	300 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	RFK	Q969G6	155 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232		Q96MT0	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	TSSK2	Q96PF2	358 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.13	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SH3D21	A4FU49	640 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	WIPF3	A6NGB9	483 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GLCE	O94923	617 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	HRG	P04196	525 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ITGA5	P08648	1049 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CLU	P10909	449 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	IGHV1-2	P23083	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	LAP3	P28838	519 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	IL5RA	Q01344	420 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	TGFBR3	Q03167	851 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GLO1	Q04760	184 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ETFDH	Q16134	617 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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