RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 FN3KQ9H479 309 aa14.97□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.97□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.97□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.97□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 OR6C68A6NDL8 312 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 CD8B2A6NJW9 211 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 IDH3BO43837 385 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 HMGN1P05114 100 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 PCYT1AP49585 367 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 RBPJQ06330 500 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 IGFBP7Q16270 282 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 LEG1Q6P5S2 330 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 SVOPQ8N4V2 548 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 DDOQ99489 341 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 BCO1Q9HAY6 547 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 YES1P07947 543 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 MVKQ03426 396 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 FOXF2Q12947 444 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 NIPAL3Q6P499 406 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 OTULINQ96BN8 352 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 TSSK2Q96PF2 358 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 OR2M2Q96R28 347 aa14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NF1-211ENST00000487476 CHD6Q8TD26 2715 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 ZNF432O94892 652 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 CLUP10909 449 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 FCGR2AP12318 317 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 GABRB1P18505 474 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 TGFBR1P36897 503 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 TGFBR2P37173 567 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 OR6X1Q8NH79 312 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PTP4A1Q93096 173 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 ZNF726A6NNF4 738 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 C1QL1O75973 258 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 GYPBP06028 91 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 GLI4P10075 376 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 AGTR1P30556 359 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 TLE1Q04724 770 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 AAED1Q7RTV5 226 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 CPOQ8IVL8 374 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 TMEM123Q8N131 208 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 NAXEQ8NCW5 288 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 APH1BQ8WW43 257 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 KCNK17Q96T54 332 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 TEX12Q9BXU0 123 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 SYT4Q9H2B2 425 aa14.95□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 POLEQ07864 2286 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PRSS37A4D1T9 235 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 ZNF724A8MTY0 619 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 DCTN6O00399 190 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 XKRYO14609 159 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 IGHV3-9P01782 118 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 LCKP06239 509 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PGA4P0DJD7 388 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PGA3P0DJD8 388 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PTGER4P35408 488 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 SIRPAP78324 504 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 FMODQ06828 376 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 PMPCAQ10713 525 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 GUSBP1Q15486 140 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 AHSA2Q719I0 299 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 CADM3Q8N126 398 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 ZNF843Q8N446 348 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 TMEM163Q8TC26 289 aa14.94□□□□□ -0.02
NF1-211ENST00000487476 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms