RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087WZY1	265 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM72	A0PK05	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	WWP2	O00308	870 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PLPP3	O14495	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC14L5	O43304	696 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GPRIN2	O60269	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TF	P02787	698 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL4	P13236	92 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PTN	P21246	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	F8A1	P23610	371 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TGFBR1	P36897	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	AQP2	P41181	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RORC	P51449	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CCR4	P51679	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	BLVRA	P53004	296 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXW4	P57775	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CTXN1	P60606	82 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FABP5	Q01469	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OXA1L	Q15070	435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PON3	Q15166	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	INA	Q16352	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MEST	Q5EB52	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF563	Q8TA94	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247		Q96M85	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	PISD	Q9UG56	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG4A-208	ENST00000489247	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms