RNA–Protein interactions for RNA: YKL008C

LAC1, Transcript of Ceramide synthase component, yeast

Gene LAC1, Length 1,257 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAC1	YKL008C	YHR078W	P38799	552 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	CTF8	P38877	133 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	KCS1	Q12494	1050 aa		5.81	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	UBP5	P39944	805 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.8	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	YLR358C	O13565	187 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	PCL2	P25693	308 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	THI21	Q08975	551 aa		5.79	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	HOG1	P32485	435 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	IRC24	P40580	263 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	SSY5	P47002	699 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	HLJ1	P48353	224 aa		5.78	□□□□□ -1.48
LAC1	YKL008C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	SAK1	P38990	1142 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MSS4	P38994	779 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	AIM14	P53109	570 aa		5.77	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	SFL1	P20134	766 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	YFL052W	P43551	465 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	ZIP2	P53061	704 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MET13	P53128	600 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	NHX1	Q04121	633 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	SWM1	Q12379	170 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.76	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MIH1	P23748	554 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	KAR4	P25583	335 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	YEL1	P34225	687 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	FLR1	P38124	548 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
LAC1	YKL008C	PZF1	P39933	429 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	VHR1	P40522	640 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	NPY1	P53164	384 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	ATG33	Q06485	197 aa		5.75	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	HMG1	P12683	1054 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	EXG2	P52911	562 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	ASM4	Q05166	528 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	PEX19	Q07418	342 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	GUP2	Q08929	609 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	YLR149C	Q99296	730 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	DNA2	P38859	1522 aa		5.74	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	STE11	P23561	717 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	YKR051W	P36142	418 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	HSL7	P38274	827 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	THI73	Q07904	523 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	GIN4	Q12263	1142 aa		5.73	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MGS1	P40151	587 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	PFA3	P42836	336 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	BNA2	P47125	453 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	ASI2	P53895	289 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	COG8	Q04632	607 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	GUD1	Q07729	489 aa		5.72	□□□□□ -1.49
LAC1	YKL008C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
LAC1	YKL008C	CTS1	P29029	562 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	TAF1	P46677	1066 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	PKH1	Q03407	766 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	ESC8	Q08119	714 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	LAS17	Q12446	633 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	GPR1	Q12361	961 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	NUP145	P49687	1317 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	DCG1	P32460	244 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	RPP1	P38786	293 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	PHO23	P50947	330 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	ENB1	Q08299	606 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	YLR415C	O13578	112 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	TSR4	P25040	408 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	CTF13	P35203	478 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	PMT3	P47190	753 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	UME1	Q03010	460 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	TRM11	Q12463	433 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	HCM1	P25364	564 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	NGG1	P32494	702 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	UBP12	P39538	1254 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	YJR096W	P47137	282 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	YGR237C	P50089	785 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	YGL081W	P53156	320 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	MRPS35	P53292	345 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LAC1	YKL008C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5

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