RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	MRX3	P38172	270 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	KIC1	P38692	1080 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	FTR1	P40088	404 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	STU2	P46675	888 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	ALF1	P53904	254 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	YDL206W	Q12424	762 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	CBF2	P32504	956 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	MMM1	P41800	426 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	TAD1	P53065	400 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RNQ1	YCL028W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	IME1	P21190	360 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	KIP1	P28742	1111 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	MUK1	Q02866	612 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	RAD54	P32863	898 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	DRE2	P36152	348 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	TVP23	P38962	199 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	LAM5	P43560	674 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	SGM1	P47166	707 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ESBP6	P53918	673 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	COX4	P04037	155 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	PET123	P17558	318 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	GLN3	P18494	730 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	PRR1	P28708	518 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	TRM2	P33753	639 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CAJ1	P39101	391 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	SEC9	P40357	651 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	HXT8	P40886	569 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	DAS1	P47005	663 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CPR7	P47103	393 aa		12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CDC11	P32458	415 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CLA4	P48562	842 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	PCD1	Q12524	340 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	BUD2	P33314	1104 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	GIS3	Q12418	502 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CDC42	P19073	191 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	DAL2	P25335	343 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	FUB1	P25659	250 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CCC2	P38995	1004 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ULI1	P43604	169 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ISM1	P48526	1002 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	GCV2	P49095	1034 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	YPL034W	Q03083	165 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	RAD57	P25301	460 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	RRT12	P25381	491 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.96	□□□□□ -0.49	not detected
RNQ1	YCL028W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	CSG2	P35206	410 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	UBX7	P38349	436 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	YAP1801	P38856	637 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	EFM4	P40516	257 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	YLR001C	Q07895	862 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	OSH2	Q12451	1283 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RNQ1	YCL028W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	EXO5	P38289	585 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YER186C	P40101	306 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	VPS70	P47161	811 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	ALT2	P52892	507 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YNL115C	P53925	644 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	PPM1	Q04081	328 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SOV1	Q04748	898 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	ECM30	Q06673	1274 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	DAS2	Q12084	232 aa		11.95	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SDH2	P21801	266 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SRB4	P32569	687 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	PTC4	P38089	393 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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