RNA–Protein interactions for RNA: Q0297

Q0297, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0297, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0297	Q0297	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	SPP1	Q03012	353 aa		18.83	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	FTR1	P40088	404 aa		18.82	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	YNL034W	P53963	612 aa		18.82	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	YNL018C	P53976	612 aa		18.82	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	MRC1	P25588	1096 aa		18.81	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	GCS1	P35197	352 aa		18.81	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	TBF1	Q02457	562 aa		18.81	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	COG4	Q06096	861 aa		18.81	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	YAP7	Q08182	245 aa		18.81	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	YHR054C	P38780	354 aa		18.8	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.8	■□□□□ 0.6	not detected
Q0297	Q0297	SLX4	Q12098	748 aa		18.8	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	YLR422W	Q06409	1932 aa		18.8	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	HAP2	P06774	265 aa		18.79	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	SYN8	P31377	255 aa		18.79	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	YHR131C	P38835	850 aa		18.79	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	TFC8	Q12308	588 aa		18.79	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	CTF3	Q12748	733 aa		18.79	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	APM2	P38700	605 aa		18.78	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	YEL023C	P39992	682 aa		18.78	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	DAS1	P47005	663 aa		18.78	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	RGA2	Q06407	1009 aa		18.78	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	CDD1	Q06549	142 aa		18.78	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	SWI3	P32591	825 aa		18.77	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	PEX2	P32800	271 aa		18.77	■□□□□ 0.6
Q0297	Q0297	IME1	P21190	360 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	VPS3	P23643	1011 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	CBF2	P32504	956 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	RPC25	P35718	212 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	PTC4	P38089	393 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	STB5	P38699	743 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	YIR016W	P40572	265 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	COS5	P47187	383 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	STP1	Q00947	519 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	SPO75	Q07798	868 aa		18.76	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	TBS1	P38114	1094 aa		18.75	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	SPC98	P53540	846 aa		18.75	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	LCD1	Q04377	747 aa		18.75	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	YML083C	Q04526	418 aa		18.75	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	MNL2	Q12205	849 aa		18.75	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	CTM1	P38818	585 aa		18.74	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	CCC2	P38995	1004 aa		18.74	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	PLP2	Q12017	286 aa		18.74	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	YET1	P35723	206 aa		18.73	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	SMC3	P47037	1230 aa		18.73	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	NUT1	P53114	1132 aa		18.73	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	ATE1	P16639	503 aa		18.72	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	APL1	P27351	700 aa		18.72	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	HMT1	P38074	348 aa		18.72	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	KIC1	P38692	1080 aa		18.72	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	SPT8	P38915	602 aa		18.72	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	FIG4	P42837	879 aa		18.72	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	18.72	■□□□□ 0.59	not detected
Q0297	Q0297	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	PSY4	P38193	441 aa		18.71	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	ALT1	P52893	592 aa		18.71	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
Q0297	Q0297	LAA1	P39526	2014 aa		18.7	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	POL31	P46957	487 aa		18.7	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	PIG1	Q06216	648 aa		18.7	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	TMA16	Q08687	178 aa		18.7	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	GIS3	Q12418	502 aa		18.7	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	GAL80	P04387	435 aa		18.69	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	RRT12	P25381	491 aa		18.69	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	MGA2	P40578	1113 aa		18.69	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	MAF1	P41910	395 aa		18.69	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	YLR297W	Q05899	129 aa		18.69	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	RAD27	P26793	382 aa		18.68	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	SSL2	Q00578	843 aa		18.68	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	YDL206W	Q12424	762 aa		18.68	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	MAS1	P10507	462 aa		18.67	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	ROX1	P25042	368 aa		18.67	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	CPR7	P47103	393 aa		18.67	■□□□□ 0.58
Q0297	Q0297	GAL10	P04397	699 aa		18.66	■□□□□ 0.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.8 ms