RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.82□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 RPS6KB1P23443 525 aa14.82□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 PSMA5P28066 241 aa14.82□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.82□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 RNF20Q5VTR2 975 aa14.82□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 Q6ZUG5 572 aa14.82□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.82□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 ZMYND15Q9H091 742 aa14.82□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 LRRC37A3O60309 1634 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 H3BQV1 296 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 IFFO2Q5TF58 517 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 IL17RAQ96F46 866 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 TNMDQ9H2S6 317 aa14.81□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 GOLIM4O00461 696 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 TAF5LO75529 589 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 NR1I2O75469 434 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 TNNI3KQ59H18 835 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 SNRKQ9NRH2 765 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 SLIT1O75093 1534 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 LTN1O94822 1766 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 COL15A1P39059 1388 aa14.8□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 CCDC192P0DO97 292 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 PTGS1P23219 599 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 LRMPQ12912 555 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 MAP3K11Q16584 847 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 NEK1Q96PY6 1258 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 CYP21A2P08686 494 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 TYRO3Q06418 890 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 APOBRQ0VD83 1088 aa14.78□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.78□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 ERBB3P21860 1342 aa14.78□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.78□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 MCM5P33992 734 aa14.78□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.78□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 HIP1O00291 1037 aa14.77□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 UVSSAQ2YD98 709 aa14.77□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.77□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.77□□□□□ -0.04
SPIN3-232ENST00000639956 CACNA1FO60840 1977 aa14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 PHKG2P15735 406 aa14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 HAND2P61296 217 aa14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 TRIM5Q9C035 493 aa14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 CABP4P57796 275 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 PGBD1Q96JS3 809 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 CYP27B1O15528 508 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 A1BGP04217 495 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 LRRC24Q50LG9 513 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 CBX8Q9HC52 389 aa14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 NFAT5O94916 1531 aa14.75□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 SCRN1Q12765 414 aa14.75□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 PDCP20941 246 aa14.75□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 KCNB2Q92953 911 aa14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 ANKRD1Q15327 319 aa14.74□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 ZNF609O15014 1411 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 GTF3C6Q969F1 213 aa14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SPIN3-232ENST00000639956 MED23Q9ULK4 1368 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms