RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, human

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	PNMA3	Q9UL41	463 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	USP54	Q70EL1	1684 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	NBPF26	B4DH59	902 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	GPR37L1	O60883	481 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	IGSF3	O75054	1194 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	DCAF5	Q96JK2	942 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	HTT	P42858	3142 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	KCNA3	P22001	575 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	PBX2	P40425	430 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	TGFB2	P61812	414 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	VAC14	Q08AM6	782 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	TATDN2	Q93075	761 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	ZIC5	Q96T25	663 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SHQ1-208	ENST00000482785	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	TSPY4	P0CV99	314 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	TSPY10	P0CW01	314 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	FDX1	P10109	184 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	MMRN1	Q13201	1228 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	PACS2	Q86VP3	889 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	CARNS1	A5YM72	827 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	HOXA2	O43364	376 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	LMNB1	P20700	586 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	FOXK2	Q01167	660 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	CNTROB	Q8N137	903 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	RDH13	Q8NBN7	331 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	UCN2	Q96RP3	112 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	CRB1	P82279	1406 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	LY75	O60449	1722 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	KANK1	Q14678	1352 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	ARHGAP33	O14559	1287 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	GCGR	P47871	477 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	MTMR2	Q13614	643 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	PNMA1	Q8ND90	353 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	CLTCL1	P53675	1640 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	SEMA3F	Q13275	785 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	PRR7	Q8TB68	274 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	RPTOR	Q8N122	1335 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	SCN4A	P35499	1836 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	CST9	Q5W186	159 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	PIM2	Q9P1W9	311 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SHQ1-208	ENST00000482785	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms