RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC102BQ68D86 513 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PARP2Q9UGN5 583 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TLDC2A0PJX2 215 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TOM1O60784 492 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTF2IP78347 998 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OTUD5Q96G74 571 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CFAP53Q96M91 514 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSEN2P49810 448 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNK17Q96T54 332 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TREHO43280 583 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOD1Q9Y239 953 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP1A2P50993 1020 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPACA7Q96KW9 195 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MORN1Q5T089 497 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SDE2Q6IQ49 451 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP6P35125 1406 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP2B1P20020 1258 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM50Q86XT4 487 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HINFPQ9BQA5 517 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADGRB2O60241 1585 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WEE1P30291 646 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NSD2O96028 1365 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGHA2P01877 340 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAPK8P45983 427 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AMPHP49418 695 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TCEAL1Q15170 157 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRINP3Q76B58 766 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EP400Q96L91 3159 aa8.27□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NWD1Q149M9 1564 aa8.27□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.27□□□□□ -1.08
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAM32Q8TC27 787 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLKQ9UBT6 870 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPSTP25325 297 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUDCQ9Y266 331 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP32Q8NFA0 1604 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF34Q969K3 372 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MST1RQ04912 1400 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DSC3Q14574 896 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HELQQ8TDG4 1101 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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