RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021306.13

Eftud2-201, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Eftud2, Length 3,324 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Usp48Q3V0C5 1052 aa9.76□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Chmp7Q8R1T1 451 aa9.76□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tmc1Q8R4P5 757 aa9.76□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Lekr1B2RVN1 116 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Terf2O35144 541 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Map3k9Q3U1V8 1077 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Fbxo2Q80UW2 297 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Olfr247E9PVJ7 320 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Olfr819K7N727 320 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Jarid2Q62315 1234 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Clcn1Q64347 994 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Atg4aQ8C9S8 396 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Plagl1Q9JLQ4 704 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Parp14Q2EMV9 1817 aa9.75□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ubn2Q80WC1 1314 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Prune1Q8BIW1 454 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Iffo2Q8R2V2 512 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Lysmd1Q9D0E3 226 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Atp1b3P97370 278 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tshz3Q8CGV9 1081 aa9.74□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kcnc4Q8R1C0 628 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kif2cQ922S8 721 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cap2Q9CYT6 476 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cnnm1Q0GA42 951 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nlgn2Q69ZK9 836 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ssh1Q76I79 1042 aa9.73□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tm6sf1P58749 370 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Llgl2Q3TJ91 1027 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Rsph3aQ3UFY4 516 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zbtb45Q52KG4 520 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Scn11aQ9R053 1765 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pou3f3P31361 497 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mcm2P97310 904 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Aldh1l2Q8K009 923 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Amotl1Q9D4H4 968 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zkscan2G3X952 960 aa9.71□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Stac3Q8BZ71 360 aa9.71□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gys2Q8VCB3 704 aa9.71□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ttc5Q99LG4 440 aa9.71□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Disp3A3KFU9 1347 aa9.71□□□□□ -0.85
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tlr7P58681 1050 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Lrch1P62046 709 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Aldh8a1Q8BH00 487 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ripk4Q9ERK0 786 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pappa2E9PZ87 1789 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Map3k2Q61083 619 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nol12Q8BG17 217 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Jakmip1Q8BVL9 626 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pdzd9Q9D9M4 266 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gm10093D3YYI8 482 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Casq1O09165 405 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Erc2Q6PH08 957 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Slc39a6Q8C145 765 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ppp6r3Q922D4 844 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tceal9Q9DD24 104 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Flt1P35969 1333 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Znf541Q0GGX2 1363 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Hspa2P17156 633 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 CenppQ9CZ92 286 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cers3Q1A3B0 383 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 PsapQ61207 557 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Dpf1Q9QX66 387 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 SlkO54988 1233 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 GckrQ91X44 587 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Spef2Q8C9J3 1734 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 MccE9PWI3 1003 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Atp8b2P98199 1209 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gja5Q01231 358 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Scn9aQ62205 1984 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mical3Q8CJ19 1993 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mmp8O70138 465 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cyp2d11P24457 504 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Neurod6P48986 337 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nkx2-3P97334 362 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Vil1Q62468 827 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 RestQ8VIG1 1082 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Map2k1P31938 393 aa9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ccdc142Q8CAI1 738 aa9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 AppP12023 770 aa9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Prkab2Q6PAM0 271 aa9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.6 ms