RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OTX2P32243 289 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CXADRP78310 365 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CAMK2DQ13557 499 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CCNJQ5T5M9 372 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PGBD5Q8N414 524 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 BEST4Q8NFU0 473 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.766e-8■■■■■ 26.8
CCSAP-201ENST00000284617 HRASLS5Q96KN8 279 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CDH20Q9HBT6 801 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 VDAC3Q9Y277 283 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS38A1L453 326 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SULT2B1O00204 365 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA10P01566 189 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R20P59543 309 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC46Q96FV0 321 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A7O60669 478 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF7P61962 342 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR7A5Q15622 319 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T11Q8NH01 316 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A12Q8TD20 617 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SFXN2Q96NB2 322 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ADOQ96SZ5 270 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 IRS2Q9Y4H2 1338 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GASTP01350 101 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PSMB5P28074 263 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 IMPA1P29218 277 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 BDKRB2P30411 391 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN2P57739 230 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PDE7AQ13946 482 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR10A5Q9H207 317 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR10A2Q9H208 303 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OLAHQ9NV23 265 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB2A1O75556 95 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 F3P13726 295 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 IRF2P14316 349 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 IL13RA1P78552 427 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CTBSQ01459 385 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD17BQ5VST6 288 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 NLGN4XQ8N0W4 816 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 NPRL2Q8WTW4 380 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP33O14559 1287 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINE2P07093 398 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 LEXMQ3ZCV2 418 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD9Q8NBP5 474 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR7G1Q8NGA0 311 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RNF128Q8TEB7 428 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB8AQ96BR9 441 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF281Q9Y2X9 895 aa19.77■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GVG6 124 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 AIFM1O95831 613 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PTGER1P34995 402 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OPRD1P41143 372 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ETV6P41212 452 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 GPR18Q14330 331 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PLK5Q496M5 336 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR2G6Q5TZ20 316 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MAVSQ7Z434 540 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 DNAAF1Q8NEP3 725 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A5Q8WUX1 472 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 PLEK2Q9NYT0 353 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE7Q9UBL6 633 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 A6NCN8 305 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR9A4Q8NGU2 314 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 AP1S3Q96PC3 154 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SULT1C2O00338 296 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 DVL2O14641 736 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 RAP2BP61225 183 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNEQ04844 493 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ILKQ13418 452 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CD300AQ9UGN4 299 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 USP22Q9UPT9 525 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GV50 99 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 MT-ND4P03905 459 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CA3P07451 260 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK1A1P48729 337 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SIMC1Q8NDZ2 872 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 LRFN1Q9P244 771 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa19.76■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF28P17035 718 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NHSL2Q5HYW2 709 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SBSNQ6UWP8 590 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN22Q8N7P3 220 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR56B2PQ8NGI1 322 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 OR56B4Q8NH76 319 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa19.75■□□□□ 0.75
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A6O15403 523 aa19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms