RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M TRS130Q03660 1102 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS20Q04272 221 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC10Q08118 586 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PSK2Q08217 1101 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ELG1Q12050 791 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M OSH2Q12451 1283 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RRD2Q12461 358 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HXK1P04806 485 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M APE1P14904 514 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO11P23179 398 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RPC53P25441 422 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC15P27636 974 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M DPH2P32461 534 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS35P34110 944 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL1P34225 687 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M COY1P34237 679 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SEG2P34250 1132 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MAL33P38157 468 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YAP1801P38856 637 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YFL034WP43564 1073 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M VTC2P43585 828 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.89□□□□□ -1.95not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR153WP48238 217 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HSH155P49955 971 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CDD1Q06549 142 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP25Q08023 583 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TLG2Q08144 397 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL216WQ08964 1102 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PLP2Q12017 286 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MYO1P08964 1928 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HIS4P00815 799 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CAN1P04817 590 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HAP2P06774 265 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ALG1P16661 449 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M KGD2P19262 463 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PGS1P25578 521 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RDS1P25611 832 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M URA1P28272 314 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ASF1P32447 279 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CBF2P32504 956 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD54P32863 898 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RPT1P33299 467 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MAP2P38174 421 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SIP5P40210 489 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ULI1P43604 169 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M FAA4P47912 694 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CCM1P48237 864 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ISM1P48526 1002 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SPC98P53540 846 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M STP1Q00947 519 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TBF1Q02457 562 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PML39Q03760 334 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SNU56Q03782 492 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M COG8Q04632 607 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M FUS2Q05670 677 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM7Q06200 448 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL057WQ07379 328 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SAM3Q08986 587 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M UBR2Q07963 1872 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M FOB1O13329 566 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ASP3-2P0CX77 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ASP3-3P0CX78 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ASP3-4P0CX79 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ASP3-1P0CZ17 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M CKA2P19454 339 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M IME1P21190 360 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS3P23643 1011 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SGF29P25554 259 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX34P25584 144 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YSC83P32792 385 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M MNN4P36044 1178 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR056WP38081 501 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M TBS1P38114 1094 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MMS4P38257 691 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SIF2P38262 535 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT5P38695 592 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M MED6P38782 295 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP5P39944 805 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL023CP39992 682 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP82P40368 713 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ROG3P43602 733 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M POL31P46957 487 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M NPA3P47122 385 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M SFB2P53953 876 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YHM2Q04013 314 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL277CQ08989 487 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 188.3 ms