RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J TRS130Q03660 1102 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS20Q04272 221 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC10Q08118 586 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PSK2Q08217 1101 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ELG1Q12050 791 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J OSH2Q12451 1283 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RRD2Q12461 358 aa2.9□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HXK1P04806 485 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J APE1P14904 514 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO11P23179 398 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC53P25441 422 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC15P27636 974 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J DPH2P32461 534 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS35P34110 944 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL1P34225 687 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J COY1P34237 679 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SEG2P34250 1132 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MAL33P38157 468 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YAP1801P38856 637 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL034WP43564 1073 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J VTC2P43585 828 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data2.89□□□□□ -1.95not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR153WP48238 217 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HSH155P49955 971 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HCR1Q05775 265 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CDD1Q06549 142 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP25Q08023 583 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TLG2Q08144 397 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL216WQ08964 1102 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PLP2Q12017 286 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MYO1P08964 1928 aa2.89□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HIS4P00815 799 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CAN1P04817 590 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HAP2P06774 265 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG1P16661 449 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J KGD2P19262 463 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PGS1P25578 521 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RDS1P25611 832 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J URA1P28272 314 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ASF1P32447 279 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CBF2P32504 956 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD54P32863 898 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RPT1P33299 467 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PRX1P34227 261 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MAP2P38174 421 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SIP5P40210 489 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ULI1P43604 169 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J FAA4P47912 694 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CCM1P48237 864 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ISM1P48526 1002 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC98P53540 846 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J STP1Q00947 519 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TBF1Q02457 562 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PML39Q03760 334 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SNU56Q03782 492 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J COG8Q04632 607 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J FUS2Q05670 677 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM7Q06200 448 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL057WQ07379 328 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SAM3Q08986 587 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J UBR2Q07963 1872 aa2.88□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J FOB1O13329 566 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ASP3-2P0CX77 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ASP3-3P0CX78 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ASP3-4P0CX79 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ASP3-1P0CZ17 362 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J CKA2P19454 339 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J IME1P21190 360 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS3P23643 1011 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SGF29P25554 259 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX34P25584 144 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MUD1P32605 298 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YSC83P32792 385 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J MNN4P36044 1178 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR056WP38081 501 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J TBS1P38114 1094 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MMS4P38257 691 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SIF2P38262 535 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT5P38695 592 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J MED6P38782 295 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J UBP5P39944 805 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL023CP39992 682 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP82P40368 713 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ROG3P43602 733 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J POL31P46957 487 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J NPA3P47122 385 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J ASN1P49089 572 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J SFB2P53953 876 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YHM2Q04013 314 aa2.87□□□□□ -1.95
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL277CQ08989 487 aa2.87□□□□□ -1.95
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