RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	AGX1	P43567	385 aa		5	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	JJJ2	P46997	583 aa		5	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YGL242C	P53066	181 aa		5	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YGR067C	P53243	804 aa		5	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	HAP5	Q02516	242 aa		5	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	HAP1	P0CE41	1502 aa		5	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	KIP2	P28743	706 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	RRM3	P38766	723 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	NUP60	P39705	539 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	GEM1	P39722	662 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MGR3	Q04472	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MCP2	Q06567	569 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	REC8	Q12188	680 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	CLB4	P24871	460 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SMI1	P32566	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SFA1	P32771	386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	DSS1	P39112	969 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	VID27	P40157	782 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	DAK2	P43550	591 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ILM1	P47155	203 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	COG6	P53959	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	LAP2	Q10740	671 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YPR089W	O13585	888 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	TUP1	P16649	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MEI5	P32489	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	PEX6	P33760	1030 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	JLP2	P40206	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	KAP114	P53067	1004 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	LIF1	P53150	421 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	CGR1	P53188	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ALF1	P53904	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SAS4	Q04003	481 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	PIG1	Q06216	648 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SCM3	Q12334	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	HAT1	Q12341	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SNF2	P22082	1703 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	CAT8	P39113	1433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
SFI1	YLL003W	SIR3	P06701	978 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	RSR1	P13856	272 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SCT1	P32784	759 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	RIB7	P33312	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	FZO1	P38297	855 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	HXT7	P39004	570 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	BIM1	P40013	344 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	FCY21	P40039	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YFL066C	P43538	392 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ESBP6	P53918	673 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	GTR1	Q00582	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SGO1	Q08490	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MET7	Q08645	548 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	KIN3	P22209	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MCM2	P29469	868 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	EUG1	P32474	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	PEP7	P32609	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MMM1	P41800	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	SAE2	P46946	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	YJL055W	P47044	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	TOM22	P49334	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	MRPL50	P53724	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	BET4	Q00618	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	TAF11	Q04226	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	PGC1	Q08959	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	PHM7	Q12252	991 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	RGP1	P16664	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	DOA4	P32571	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	RCY1	P39531	840 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ATG32	P40458	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	STB1	P42845	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	ATH1	P48016	1211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SFI1	YLL003W	CWH41	P53008	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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