RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W AI3P03877 415 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.72□□□□□ -1.49not detected
YKR047WYKR047W TRK2P28584 889 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W RPC82P32349 654 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W FUI1P38196 639 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W MMM1P41800 426 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W HXT16P47185 567 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YGR153WP48238 217 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W HFM1P51979 1187 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W YDR338CQ05497 695 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W RSC58Q07979 502 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR047WYKR047W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W DIF1O13577 133 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YCL002CP25565 263 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W URA1P28272 314 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W TDA3P38758 523 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W RLP7P40693 322 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W MNN11P46985 422 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W NIT2P47016 307 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data5.71□□□□□ -1.5not detected
YKR047WYKR047W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W RMP1Q12530 201 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W NOT3P06102 836 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W DAL3P32459 195 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W SAP190P36123 1033 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W HSL7P38274 827 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YAP1801P38856 637 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W AKR1P39010 764 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W SHR5P41912 237 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W CIT3P43635 486 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W XYL2Q07993 356 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W ENA1P13587 1091 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W TRX2P22803 104 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W MIH1P23748 554 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W CYS3P31373 394 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W CCR4P31384 837 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W DID4P36108 232 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W GPP2P40106 250 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W CEP3P40969 608 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W RET2P43621 546 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W RCM1P53972 490 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W ENA2Q01896 1091 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W VPS30Q02948 557 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W ATG16Q03818 150 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W ENA5Q12691 1091 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W AIM26P32858 118 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data5.68□□□□□ -1.5not detected
YKR047WYKR047W PIP2P52960 996 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W NPY1P53164 384 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W MET14Q02196 202 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W ECM9Q02202 377 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W CRR1Q05790 422 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PRC1P00729 532 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PIF1P07271 859 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W DPB3P27344 201 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W HSP78P33416 811 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W NIC96P34077 839 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W RFC5P38251 354 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W SET5P38890 526 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W CCT5P40413 562 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PRY1P47032 299 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PBP1P53297 722 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W HDA1P53973 706 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W UBX4P54730 416 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YPL062WQ02781 134 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PHM6Q05637 104 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W APL1P27351 700 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W STE13P33894 931 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W BIT2P38346 545 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W GTS1P40956 396 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YFL052WP43551 465 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W RAI1P53063 387 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PUS2P53167 370 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YKR011CQ02209 353 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W TDA6Q06466 467 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.66□□□□□ -1.5not detected
YKR047WYKR047W THI72Q08579 599 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W TRE1Q08919 783 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W GAL1P04385 528 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W SPS1P08458 490 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PGI1P12709 554 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W RPD3P32561 433 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W SRP101P32916 621 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YKR051WP36142 418 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W PEX7P39108 375 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W SPC105P53148 917 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YGR021WP53212 290 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W YHM2Q04013 314 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR047WYKR047W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.2 ms