RNA–Protein interactions for RNA: YGR229C

SMI1, Transcript of Protein involved in the regulation of cell wall synthesis, yeast

Gene SMI1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMI1	YGR229C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SCT1	P32784	759 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RER2	P35196	286 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YJL055W	P47044	245 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	MON1	P53129	644 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	TAF11	Q04226	346 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YKU80	Q04437	629 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	ESC8	Q08119	714 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	CDC9	P04819	755 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	AAC3	P18238	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RAD16	P31244	790 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	ORC2	P32833	620 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	DUR3	P33413	735 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SKN7	P38889	622 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	VPS41	P38959	992 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	MBP1	P39678	833 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YIL166C	P40445	542 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YML6	P51998	286 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	NUT1	P53114	1132 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PLP2	Q12017	286 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SPO21	Q12411	609 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RAD18	P10862	487 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	FUS1	P11710	512 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	MET8	P15807	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RAD53	P22216	821 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PCL2	P25693	308 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YBR284W	P38150	797 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	ALG14	P38242	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	HXT13	P39924	564 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YJL181W	P46987	611 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	HXT17	P53631	564 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	HXT15	P54854	567 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	CTR9	P89105	1077 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	HIM1	Q06674	414 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	APC5	Q08683	685 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SLP1	Q12232	587 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SCM3	Q12334	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	CHD1	P32657	1468 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	COB	P00163	385 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	BI4	P03879	638 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	MRP7	P12687	371 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SFL1	P20134	766 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RER1	P25560	188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PGS1	P25578	521 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SWC3	P31376	625 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	BIT2	P38346	545 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PAN5	P38787	379 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	JEM1	P40358	645 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
SMI1	YGR229C	MRPL19	P53875	158 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	TIM10	P87108	93 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	GIS4	Q04233	774 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	ENT1	Q12518	454 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	MRP10	O75012	95 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SRD1	P09007	221 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PHO81	P17442	1178 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	DAL7	P21826	554 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RPC53	P25441	422 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	POL4	P25615	582 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	LYP1	P32487	611 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	PSY4	P38193	441 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	NPR3	P38742	1146 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	CKB2	P38930	258 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	LEM3	P42838	414 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	ENV11	P53246	860 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SMI1	YGR229C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.3 ms