RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W BCK1Q01389 1478 aa6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W THS1P04801 734 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YSC84P32793 468 aa6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W ALT1P52893 592 aa6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YGR035CP53222 116 aa6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YNR014WP53719 212 aa6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W MTC5Q03897 1148 aa6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W HRQ1Q05549 1077 aa6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W NUP145P49687 1317 aa6.5□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W ROX1P25042 368 aa6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W VBA3P25594 458 aa6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W SFA1P32771 386 aa6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W UGA2P38067 497 aa6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W TOK1P40310 691 aa6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W ATG36P46983 293 aa6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YGR237CP50089 785 aa6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W COQ4O13525 335 aa6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W PCT1P13259 424 aa6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W MRC1P25588 1096 aa6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W REC104P33323 182 aa6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W TYS1P36421 394 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W GAS5Q08193 484 aa6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W TRM3Q07527 1436 aa6.48□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W HAP1P0CE41 1502 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W RSC6P25632 483 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W AFR1P33304 620 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W SPC29P33419 253 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YKL151CP36059 337 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W ERT1P38140 529 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W DJP1P40564 432 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YFL054CP43549 646 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W SDA1P53313 767 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YLR001CQ07895 862 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W THI73Q07904 523 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YLL058WQ12198 575 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YML133CQ03099 1374 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YLL067CQ07888 1374 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YLL066CQ99208 1374 aa6.47□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W DAL5P15365 543 aa6.46□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W SNF5P18480 905 aa6.46□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W NPP1P25353 742 aa6.46□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YIL092WP40497 633 aa6.46□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W KRE5P22023 1365 aa6.46□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W AI1P03875 834 aa6.45□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W CDC9P04819 755 aa6.45□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W BAP2P38084 609 aa6.45□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W CCZ1P38273 704 aa6.45□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W SEC26P41810 973 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data6.45□□□□□ -1.38not detected
VHS1YDR247W BUD9P53226 547 aa6.45□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W UME1Q03010 460 aa6.45□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W TOP1P04786 769 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W GRX7P38068 203 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W PIK1P39104 1066 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W SBE2P42223 864 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W GYP8P43570 497 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W TCB2P48231 1178 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W GYP7P48365 746 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W DAM1P53267 343 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W THI22Q06490 572 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W MDM38Q08179 573 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W DNF3Q12674 1656 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W AI3P03877 415 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W BI4P03879 638 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W SRD1P09007 221 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W MDJ1P35191 511 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W MNN4P36044 1178 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W VPS24P36095 224 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W NIT3P49954 291 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W FOL1P53848 824 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W ALO1P54783 526 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W EAR1Q03212 550 aa6.44□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W PRD1P25375 712 aa6.43□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YEL1P34225 687 aa6.43□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W EMC3P36039 253 aa6.43□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YHL012WP38709 493 aa6.43□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YER158CP40095 573 aa6.43□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W TMA17Q12513 150 aa6.43□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W RAD18P10862 487 aa6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data6.42□□□□□ -1.38not detected
VHS1YDR247W SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W CDC48P25694 835 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W STO1P34160 861 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W MTC2P34246 357 aa6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W MGS1P40151 587 aa6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W ATP25Q03153 612 aa6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
VHS1YDR247W YOL057WQ08225 711 aa6.42□□□□□ -1.38
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