RNA–Protein interactions for RNA: Q0065

AI4, Transcript of Endonuclease I-SceII, yeast

Gene AI4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI4	Q0065	KCS1	Q12494	1050 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	LCD1	Q04377	747 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	PET10	P36139	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	YGL081W	P53156	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	UGO1	Q03327	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	XYL2	Q07993	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	ENA1	P13587	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	MSH2	P25847	964 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	RPC82	P32349	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	ENA2	Q01896	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	ENB1	Q08299	606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	ENA5	Q12691	1091 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	BET3	P36149	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	YRO2	P38079	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	MNN1	P39106	762 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	GYP7	P48365	746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	RTA1	P53047	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	MDM38	Q08179	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	ERR1	P0CX10	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	ERR2	P0CX11	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	GDH3	P39708	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	ATF1	P40353	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	MTC3	P53077	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	LAS17	Q12446	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	FUN30	P31380	1131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	REC104	P33323	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	YKL151C	P36059	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	YAP1801	P38856	637 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	YPR071W	Q12346	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AI4	Q0065	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	GSY1	P23337	708 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YBR284W	P38150	797 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	SRT1	Q03175	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	CDA1	Q06702	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	NPC2	Q12408	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	PEX6	P33760	1030 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YER158C	P40095	573 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	ALG2	P43636	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	BUL1	P48524	976 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	DAM1	P53267	343 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	OSW2	Q12202	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	SPE1	P08432	466 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	TOP3	P13099	656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	STU2	P46675	888 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	NIT3	P49954	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YGR012W	P53206	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YLR040C	Q07988	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YOL073C	Q08232	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	MDM12	Q92328	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	SFP1	P32432	683 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	TOK1	P40310	691 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	AFR1	P33304	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	GIC1	P38785	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YKE2	P52553	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	NCS6	P53088	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	TMN2	Q04562	672 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	NTG2	Q08214	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	MAL11	P53048	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
AI4	Q0065	NPP1	P25353	742 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YEL1	P34225	687 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	EMC3	P36039	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	VPS30	Q02948	557 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	ATP25	Q03153	612 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YPR196W	Q06595	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	OMS1	Q06668	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	MCH5	Q08777	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	GUP2	Q08929	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	MPH2	P0CD99	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	KAR4	P25583	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	SRP101	P32916	621 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	SPC29	P33419	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	KTR4	P38131	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	SUL1	P38359	859 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	SNM1	P40993	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	YDR514C	Q04408	483 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	COG8	Q04632	607 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	REH1	Q06709	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
AI4	Q0065	HSF1	P10961	833 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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