RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639994.1

SLC35A3-218, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-218ENST00000639994 CREBZFQ9NS37 354 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC35A3-218ENST00000639994 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC35A3-218ENST00000639994 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 FZD9O00144 591 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 PDIA6Q15084 440 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 PROSER3Q2NL68 480 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 PSMD1Q99460 953 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 HACL1Q9UJ83 578 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 JDP2Q8WYK2 163 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 NECTIN2Q92692 538 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 EPHX2P34913 555 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 NEUROD2Q15784 382 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 COL4A5P29400 1685 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 PASKQ96RG2 1323 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 PARP10Q53GL7 1025 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 GPC2Q8N158 579 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC35A3-218ENST00000639994 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 NLRP3Q96P20 1036 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 TNS4Q8IZW8 715 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 KRT24Q2M2I5 525 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 COPS6Q7L5N1 327 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 CAPN15O75808 1086 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 CNTNAP1P78357 1384 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 CNTROBQ8N137 903 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 ZNF428Q96B54 188 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SLC35A3-218ENST00000639994 LTBP1Q14766 1721 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 ABCC4O15439 1325 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 LAMB2P55268 1798 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 PPIP5K2O43314 1243 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 NLRP10Q86W26 655 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 NIM1KQ8IY84 436 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 CHL1O00533 1208 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 AOC3Q16853 763 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 RUNDC1Q96C34 613 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 EPS15P42566 896 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 VEGFBP49765 207 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 SCNN1DP51172 638 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 TCIRG1Q13488 830 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC35A3-218ENST00000639994 TAF1P21675 1872 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 FOXN1O15353 648 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 BBOX1O75936 387 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 SP8Q8IXZ3 490 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 MPNDQ8N594 471 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 GRAPQ13588 217 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 CXCL9Q07325 125 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 VPS33BQ9H267 617 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC35A3-218ENST00000639994 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.53■■□□□ 1.84
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