RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		18.31	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	SCN4A	P35499	1836 aa		18.3	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	GPC2	Q8N158	579 aa		18.3	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		18.3	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	HACL1	Q9UJ83	578 aa		18.3	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	EPHX2	P34913	555 aa		18.29	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	RIPK4	P57078	832 aa		18.29	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	PARP10	Q53GL7	1025 aa		18.29	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		18.29	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	COL4A5	P29400	1685 aa		18.28	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		18.28	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	PROSER3	Q2NL68	480 aa		18.28	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		18.28	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		18.28	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	CNTNAP1	P78357	1384 aa		18.28	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	NUP98	P52948	1817 aa		18.28	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		18.27	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		18.27	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	JDP2	Q8WYK2	163 aa		18.27	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
MUC1-222	ENST00000610468	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.25	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	TNS4	Q8IZW8	715 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	NLRP3	Q96P20	1036 aa		18.24	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	CHL1	O00533	1208 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	ANXA1	P04083	346 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.23	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	SCNN1D	P51172	638 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	COPS6	Q7L5N1	327 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	NLRP10	Q86W26	655 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	ABCC4	O15439	1325 aa		18.22	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	CNTROB	Q8N137	903 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	VPS33B	Q9H267	617 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	18.21	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		18.21	■□□□□ 0.51
MUC1-222	ENST00000610468	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	LTBP1	Q14766	1721 aa		18.2	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	RASSF10	A6NK89	507 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	HOXB7	P09629	217 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	VEGFB	P49765	207 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	TCIRG1	Q13488	830 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	KRT24	Q2M2I5	525 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	NIM1K	Q8IY84	436 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	RUNDC1	Q96C34	613 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	PPIP5K2	O43314	1243 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	BBOX1	O75936	387 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	EPS15	P42566	896 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	NECTIN2	Q92692	538 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	AOC3	Q16853	763 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	FOXN1	O15353	648 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	NEUROD2	Q15784	382 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	GRAP	Q13588	217 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	18.15	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		18.14	■□□□□ 0.5
MUC1-222	ENST00000610468	CXCL9	Q07325	125 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MUC1-222	ENST00000610468	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MUC1-222	ENST00000610468	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MUC1-222	ENST00000610468	TMC4	Q7Z404	712 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MUC1-222	ENST00000610468	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MUC1-222	ENST00000610468	WBP1L	Q9NX94	342 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MUC1-222	ENST00000610468	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49

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