RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 HACL1Q9UJ83 578 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa29.06■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 COL4A5P29400 1685 aa29.05■■■□□ 2.24
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E2F4-210ENST00000568485 RIPK4P57078 832 aa29.04■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 EPHX2P34913 555 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 RALBP1Q15311 655 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.03■■■□□ 2.24
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E2F4-210ENST00000568485 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.03■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
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E2F4-210ENST00000568485 GPC2Q8N158 579 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 CRAMP1Q96RY5 1269 aa29.02■■■□□ 2.24
E2F4-210ENST00000568485 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
E2F4-210ENST00000568485 PROSER3Q2NL68 480 aa29.01■■■□□ 2.23
E2F4-210ENST00000568485 PARP10Q53GL7 1025 aa29.01■■■□□ 2.23
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E2F4-210ENST00000568485 JDP2Q8WYK2 163 aa29■■■□□ 2.23
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E2F4-210ENST00000568485 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.99■■■□□ 2.23
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E2F4-210ENST00000568485 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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E2F4-210ENST00000568485 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.95■■■□□ 2.22
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E2F4-210ENST00000568485 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.95■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.94■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 COPS6Q7L5N1 327 aa28.92■■■□□ 2.22
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E2F4-210ENST00000568485 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.92■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.92■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 ABCC4O15439 1325 aa28.92■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.91■■■□□ 2.22
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E2F4-210ENST00000568485 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.91■■■□□ 2.22
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E2F4-210ENST00000568485 CHL1O00533 1208 aa28.9■■■□□ 2.22
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E2F4-210ENST00000568485 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.9■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 NLRP10Q86W26 655 aa28.9■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.9■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 VEGFBP49765 207 aa28.89■■■□□ 2.22
E2F4-210ENST00000568485 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
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E2F4-210ENST00000568485 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.88■■■□□ 2.21
E2F4-210ENST00000568485 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
E2F4-210ENST00000568485 EPS15P42566 896 aa28.87■■■□□ 2.21
E2F4-210ENST00000568485 TCIRG1Q13488 830 aa28.87■■■□□ 2.21
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E2F4-210ENST00000568485 FOXN1O15353 648 aa28.86■■■□□ 2.21
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E2F4-210ENST00000568485 GRAPQ13588 217 aa28.8■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.8■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.79■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 MPNDQ8N594 471 aa28.79■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 WBP1LQ9NX94 342 aa28.79■■■□□ 2.2
E2F4-210ENST00000568485 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.79■■■□□ 2.2
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