RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555540.1

KRT18P6-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene KRT18P6, Length 1,265 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P6-201ENST00000555540 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.85■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 TNS4Q8IZW8 715 aa26.84■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 NTSR2O95665 410 aa26.83■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 EPHX2P34913 555 aa26.83■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 GPC2Q8N158 579 aa26.83■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 JDP2Q8WYK2 163 aa26.83■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.83■■□□□ 1.89
KRT18P6-201ENST00000555540 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 RIPK4P57078 832 aa26.82■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.81■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.81■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.81■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.81■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.81■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 COL4A5P29400 1685 aa26.81■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 CNTNAP1P78357 1384 aa26.81■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 PDIA6Q15084 440 aa26.8■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 PARP10Q53GL7 1025 aa26.8■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.8■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 RALBP1Q15311 655 aa26.79■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.78■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.78■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.77■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 NLRP3Q96P20 1036 aa26.77■■□□□ 1.88
KRT18P6-201ENST00000555540 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.76■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 PROSER3Q2NL68 480 aa26.76■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 SLC51AQ86UW1 340 aa26.76■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.76■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 ANXA1P04083 346 aa26.75■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.75■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 LTBP1Q14766 1721 aa26.75■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 CAPN15O75808 1086 aa26.74■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.74■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 CNTROBQ8N137 903 aa26.74■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 LAMB2P55268 1798 aa26.73■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 VEGFBP49765 207 aa26.72■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.71■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 ABCC4O15439 1325 aa26.7■■□□□ 1.87
KRT18P6-201ENST00000555540 SCNN1DP51172 638 aa26.7■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.7■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 COPS6Q7L5N1 327 aa26.7■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 NIM1KQ8IY84 436 aa26.7■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 NECTIN2Q92692 538 aa26.7■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 PPIP5K2O43314 1243 aa26.69■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.69■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 VPS33BQ9H267 617 aa26.69■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 FOXN1O15353 648 aa26.68■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 EPS15P42566 896 aa26.68■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 NLRP10Q86W26 655 aa26.68■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 RASSF10A6NK89 507 aa26.67■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 NEUROD2Q15784 382 aa26.67■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 AOC3Q16853 763 aa26.67■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.67■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.67■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 CHL1O00533 1208 aa26.66■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 TCIRG1Q13488 830 aa26.66■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.66■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 BBOX1O75936 387 aa26.65■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.65■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 KRT24Q2M2I5 525 aa26.64■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 SP8Q8IXZ3 490 aa26.64■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 AIDAQ96BJ3 306 aa26.64■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
KRT18P6-201ENST00000555540 RUNDC1Q96C34 613 aa26.63■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.63■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.63■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.63■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 WBP1LQ9NX94 342 aa26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.62■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 CXCL9Q07325 125 aa26.61■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 MPNDQ8N594 471 aa26.61■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.61■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 TAF1P21675 1872 aa26.61■■□□□ 1.85
KRT18P6-201ENST00000555540 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.5 ms