RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 CREBZFQ9NS37 354 aa30■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 HACL1Q9UJ83 578 aa30■■■□□ 2.39
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PKP3-210ENST00000533249 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.99■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 PDIA6Q15084 440 aa29.99■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.99■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 FZD9O00144 591 aa29.98■■■□□ 2.39
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PKP3-210ENST00000533249 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.98■■■□□ 2.39
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PKP3-210ENST00000533249 PARP10Q53GL7 1025 aa29.97■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.97■■■□□ 2.39
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PKP3-210ENST00000533249 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.97■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 EPHX2P34913 555 aa29.96■■■□□ 2.39
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PKP3-210ENST00000533249 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.96■■■□□ 2.39
PKP3-210ENST00000533249 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.96■■■□□ 2.39
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PKP3-210ENST00000533249 COL4A5P29400 1685 aa29.93■■■□□ 2.38
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PKP3-210ENST00000533249 NLRP3Q96P20 1036 aa29.93■■■□□ 2.38
PKP3-210ENST00000533249 GJA3Q9Y6H8 435 aa29.93■■■□□ 2.38
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PKP3-210ENST00000533249 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.91■■■□□ 2.38
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PKP3-210ENST00000533249 XAGE3Q8WTP9 111 aa29.91■■■□□ 2.38
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PKP3-210ENST00000533249 TNS4Q8IZW8 715 aa29.9■■■□□ 2.38
PKP3-210ENST00000533249 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa29.9■■■□□ 2.38
PKP3-210ENST00000533249 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.89■■■□□ 2.38
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PKP3-210ENST00000533249 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
PKP3-210ENST00000533249 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
PKP3-210ENST00000533249 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.74■■■□□ 2.35
PKP3-210ENST00000533249 CXCL9Q07325 125 aa29.73■■■□□ 2.35
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