RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 FRMD6Q96NE9 622 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 AK5Q9Y6K8 562 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF76P36508 570 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 USP20Q9Y2K6 914 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 UPP2O95045 317 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 INPP5BP32019 993 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 ARSDP51689 593 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF217Q8TC41 542 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 SPG7Q9UQ90 795 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFRSF21O75509 655 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 CTSHP09668 335 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 MMRN1Q13201 1228 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 CRELD1Q96HD1 420 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR20EP86478 221 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR20CP86479 221 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR20DP86480 221 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR20BP86481 221 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR20AP86496 221 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 BTLAQ7Z6A9 289 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 ZIC5Q96T25 663 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 BMP2P12643 396 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR44Q5JSH3 913 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 XKR5Q6UX68 686 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF438Q7Z4V0 828 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 SNX29Q8TEQ0 813 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 TGIF2Q9GZN2 237 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 NEUROD4Q9HD90 331 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNMB2Q9Y691 235 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 UBAP1LF5GYI3 381 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 MSX1P28360 303 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 C6orf118Q5T5N4 469 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PI16Q6UXB8 463 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 CCSER2Q9H7U1 834 aa12.04□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1B0GTH6 734 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 IRS1P35568 1242 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 TINF2Q9BSI4 451 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PGGT1B-205ENST00000514178 RHOQP17081 205 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 GRNP28799 593 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 UBXN4Q92575 508 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 ELP3Q9H9T3 547 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa12.02□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 PHACTR2O75167 634 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 OSBPL7Q9BZF2 842 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 C12orf49Q9H741 205 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PNR3 127 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 TYRO3Q06418 890 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 NLRP2Q9NX02 1062 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 GIPC1O14908 333 aa11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 TTLL8A6PVC2 850 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 EPB42P16452 691 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP63Q96MT8 703 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 CAPN10Q9HC96 672 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 NPHS2Q9NP85 383 aa11.98□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.97□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 XYLBO75191 536 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 CHRDQ9H2X0 955 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1B-205ENST00000514178 TNNI2P48788 182 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF394Q53GI3 561 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 GPAMQ9HCL2 828 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM8A1Q9UBU6 413 aa11.95□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 RUBCNLQ9H714 662 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTN3Q9P232 1028 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 USP31Q70CQ4 1352 aa11.93□□□□□ -0.5
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