RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512343.5

RASGEF1B-209, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-209ENST00000512343 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.94■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 PCNTO95613 3336 aa28.93■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 LDHDQ86WU2 507 aa28.93■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 NECTIN2Q92692 538 aa28.93■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 ERBB4Q15303 1308 aa28.93■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.93■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 FZD9O00144 591 aa28.92■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 CREBZFQ9NS37 354 aa28.92■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 RALBP1Q15311 655 aa28.91■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.91■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 PSMD1Q99460 953 aa28.91■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 HACL1Q9UJ83 578 aa28.91■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.91■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa28.9■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 NEUROD2Q15784 382 aa28.9■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 PASKQ96RG2 1323 aa28.9■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 EPHX2P34913 555 aa28.89■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.89■■■□□ 2.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.88■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.88■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRT24Q2M2I5 525 aa28.87■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 JDP2Q8WYK2 163 aa28.87■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.87■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 LAMB2P55268 1798 aa28.87■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 LTBP1Q14766 1721 aa28.86■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.86■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.86■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 PARP10Q53GL7 1025 aa28.85■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 GPC2Q8N158 579 aa28.85■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.84■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 COPS6Q7L5N1 327 aa28.84■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 TNS4Q8IZW8 715 aa28.84■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNF428Q96B54 188 aa28.84■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 CAPN15O75808 1086 aa28.83■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.83■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.83■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 NLRP3Q96P20 1036 aa28.83■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.83■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
RASGEF1B-209ENST00000512343 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 CNTNAP1P78357 1384 aa28.82■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 TAF1P21675 1872 aa28.82■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 ABCC4O15439 1325 aa28.8■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.8■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.8■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.79■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 CNTROBQ8N137 903 aa28.79■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 CHL1O00533 1208 aa28.78■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 AOC3Q16853 763 aa28.78■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 NLRP10Q86W26 655 aa28.78■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 PPIP5K2O43314 1243 aa28.77■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 EPS15P42566 896 aa28.77■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 SCNN1DP51172 638 aa28.77■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.77■■■□□ 2.2
RASGEF1B-209ENST00000512343 VEGFBP49765 207 aa28.76■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.76■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 NIM1KQ8IY84 436 aa28.76■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 RUNDC1Q96C34 613 aa28.76■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.76■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 TCIRG1Q13488 830 aa28.75■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.75■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.74■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 FOXN1O15353 648 aa28.72■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.71■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.7■■■□□ 2.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 SP8Q8IXZ3 490 aa28.69■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 BBOX1O75936 387 aa28.68■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 CXCL9Q07325 125 aa28.68■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 MPNDQ8N594 471 aa28.68■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.67■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.67■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.67■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.67■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.66■■■□□ 2.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 GRAPQ13588 217 aa28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms