RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499392.1

LRAT-202, Transcript of lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LRAT, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRAT-202ENST00000499392 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.47□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 ABCC8Q09428 1581 aa7.46□□□□□ -1.21
LRAT-202ENST00000499392 TNFRSF10BO14763 440 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 SLURP2P0DP57 97 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 MBIPQ9NS73 344 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 STK17AQ9UEE5 414 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 SEPT3Q9UH03 358 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 PHF24Q9UPV7 400 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 PBRM1Q86U86 1689 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 CUX1P39880 1505 aa7.46□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 C2CD2LO14523 706 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 KCNQ4P56696 695 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 CTBSQ01459 385 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 TYRO3Q06418 890 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 PDE4CQ08493 712 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 DGKZQ13574 1117 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 LAMC2Q13753 1193 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 HIF1AQ16665 826 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 FAM182BQ5T319 152 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 C16orf46Q6P387 395 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 STRN4Q9NRL3 753 aa7.45□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.44□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.44□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 FGFR3P22607 806 aa7.44□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 FAM26DQ5JW98 314 aa7.44□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.43□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 MX2P20592 715 aa7.43□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 INPP5BP32019 993 aa7.43□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 IFT43Q96FT9 208 aa7.43□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 IGF1RP08069 1367 aa7.43□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.42□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 OPLAHO14841 1288 aa7.42□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 MICAL2O94851 1124 aa7.42□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 ADAMTS2O95450 1211 aa7.42□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.42□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 CEP63Q96MT8 703 aa7.42□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 CD33P20138 364 aa7.41□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 GRIN2CQ14957 1233 aa7.41□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 BRD7Q9NPI1 651 aa7.41□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 MARK1Q9P0L2 795 aa7.41□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 MAP2K3P46734 347 aa7.4□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.4□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.4□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 HELQQ8TDG4 1101 aa7.4□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 STIM2Q9P246 746 aa7.4□□□□□ -1.22
LRAT-202ENST00000499392 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ZBTB39O15060 712 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 BMP4P12644 408 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 NPR3P17342 541 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 IDH3AP50213 366 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 TREML1Q86YW5 311 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 WHAMMQ8TF30 809 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ACDQ96AP0 544 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 KLF15Q9UIH9 416 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 SYNJ1O43426 1573 aa7.38□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 SLC30A3Q99726 388 aa7.38□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 SOGA1O94964 1423 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 BRD1O95696 1058 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ARAFP10398 606 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ARSDP51689 593 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.37□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 SPEM2Q0P670 501 aa7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ECM1Q16610 540 aa7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 MDFIQ99750 246 aa7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 GSX2Q9BZM3 304 aa7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ADAMTS12P58397 1594 aa7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 SYNJ2O15056 1496 aa7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 GRIN2BQ13224 1484 aa7.36□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.35□□□□□ -1.23
LRAT-202ENST00000499392 ARHGEF15O94989 841 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms