RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC171Q6TFL3 1326 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALS2CR12Q96Q35 445 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMOD3Q9NYL9 352 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPRCP08575 1304 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DESP17661 470 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNG11P61952 73 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PANK2Q9BZ23 570 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT222Q8N1A0 295 aa19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.79■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMX3Q96JJ7 454 aa19.79■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.79■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.79■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa19.79■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSHZ3Q63HK5 1081 aa19.79■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIGD1Q96MW7 591 aa19.79■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBA5Q9GZZ9 404 aa19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIG1P18858 919 aa19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPECC1Q5M775 1068 aa19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAVIN2O95810 425 aa19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHRNA2Q15822 529 aa19.78■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC175P0C221 793 aa19.77■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STARD3NLO95772 234 aa19.77■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUCB1Q02818 461 aa19.77■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.77■□□□□ 0.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAATS1Q7Z4T9 603 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBLN1P23142 703 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NLRP5P59047 1200 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANO6Q4KMQ2 910 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MKNK2Q9HBH9 465 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBE4AQ14139 1066 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP16Q9Y5T5 823 aa19.76■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSD2O96028 1365 aa19.75■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP48Q86UV5 1035 aa19.75■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF287Q9HBT7 754 aa19.75■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JADE2Q9NQC1 790 aa19.75■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP10AO60312 1499 aa19.75■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEK1Q96PY6 1258 aa19.75■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBAP1LF5GYI3 381 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEBLO76041 1014 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP3K12Q12852 859 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM266Q2M3C6 531 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMCO5BA8MYB1 307 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FLIIQ13045 1269 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPFIA3O75145 1194 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SKILP12757 684 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB34Q9BZG1 259 aa19.74■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IQCA1Q86XH1 822 aa19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC102BQ68D86 513 aa19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOC5O00471 708 aa19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOM1O60784 492 aa19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa19.73■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IARSP41252 1262 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NECAB1Q8N987 351 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP7AQ04656 1500 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBASH3AP57075 661 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAVIN4Q5BKX8 364 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAPKBP1O60336 1514 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SDSP20132 328 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAOK3Q9H2K8 898 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPHP3Q7Z494 1330 aa19.72■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLIM4O00461 696 aa19.71■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSF2BPO75031 334 aa19.71■□□□□ 0.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KANK3Q6NY19 840 aa19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms