RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 FBF1Q8TES7 1133 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM7Q9C029 511 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 GMNNO75496 209 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TUBB4AP04350 444 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SLFN14P0C7P3 912 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 INAQ16352 499 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PHACTR2O75167 634 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TXLNAP40222 546 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 KCNA1Q09470 495 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 GNPTABQ3T906 1256 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 DRC3Q9H069 523 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PRELID1Q9Y255 219 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 A6NNZ2 444 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFAB1O14561 156 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC6Q16204 474 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RASIP1Q5U651 963 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 SRGAP3O43295 1099 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP2AO43633 222 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 KIF11P52732 1056 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 HDXQ7Z353 690 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MTRQ99707 1265 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 DKK3Q9UBP4 350 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TACC1O75410 805 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TMF1P82094 1093 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RCN1Q15293 331 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 FLT3P36888 993 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 MRGBPQ9NV56 204 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-209ENST00000442510 ATP8B1O43520 1251 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 KCNA2P16389 499 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ATP2B2Q01814 1243 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NEK2P51955 445 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 Q4G0T1 1027 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NECTIN2Q92692 538 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 YY1P25490 414 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA8P43361 318 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM110Q86TL2 294 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 HAUS1Q96CS2 278 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SIRT1Q96EB6 747 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 COG6Q9Y2V7 657 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 PDE6BP35913 854 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 CUL4BQ13620 913 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 MIEF2Q96C03 454 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 RGL1Q9NZL6 768 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 DNAI1Q9UI46 699 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM17Q9Y577 477 aa6.39□□□□□ -1.39
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