RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 LDHDQ86WU2 507 aa26.59■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 PCNTO95613 3336 aa26.59■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 POTEIP0CG38 1075 aa26.58■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 POTEJP0CG39 1038 aa26.58■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 PDIA6Q15084 440 aa26.58■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 JDP2Q8WYK2 163 aa26.58■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.58■■□□□ 1.85
ELL3-202ENST00000433927 FZD9O00144 591 aa26.57■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 NEUROD2Q15784 382 aa26.57■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.57■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 NLRP3Q96P20 1036 aa26.57■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.57■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 CREBZFQ9NS37 354 aa26.56■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 HACL1Q9UJ83 578 aa26.56■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.55■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.55■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 SNED1Q8TER0 1413 aa26.55■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 ANXA1P04083 346 aa26.54■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 PROSER3Q2NL68 480 aa26.54■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 GPC2Q8N158 579 aa26.54■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 RUNDC1Q96C34 613 aa26.54■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.53■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 EPHX2P34913 555 aa26.52■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.52■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 COPS6Q7L5N1 327 aa26.52■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 NECTIN2Q92692 538 aa26.52■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.52■■□□□ 1.84
ELL3-202ENST00000433927 CHL1O00533 1208 aa26.51■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.5■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.5■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.5■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 PASKQ96RG2 1323 aa26.49■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.48■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.48■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 TCIRG1Q13488 830 aa26.47■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 NLRP10Q86W26 655 aa26.47■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.47■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.47■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.47■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
ELL3-202ENST00000433927 HOXB7P09629 217 aa26.45■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 KRT24Q2M2I5 525 aa26.45■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 NIM1KQ8IY84 436 aa26.45■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 VPS33BQ9H267 617 aa26.45■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 ABCC4O15439 1325 aa26.44■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.44■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 BBOX1O75936 387 aa26.44■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.44■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.44■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.44■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 COL4A5P29400 1685 aa26.44■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.43■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.43■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 PPIP5K2O43314 1243 aa26.43■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 CNTROBQ8N137 903 aa26.42■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 CFAP44Q96MT7 982 aa26.42■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 CNTNAP1P78357 1384 aa26.42■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 LAMB2P55268 1798 aa26.41■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 SP8Q8IXZ3 490 aa26.41■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.4■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 SLC51AQ86UW1 340 aa26.4■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.4■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 AOC3Q16853 763 aa26.39■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 TNS4Q8IZW8 715 aa26.39■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ELL3-202ENST00000433927 SCNN1DP51172 638 aa26.38■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 GRAPQ13588 217 aa26.38■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 MPNDQ8N594 471 aa26.38■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 HYPKQ9NX55 129 aa26.38■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 TMC4Q7Z404 712 aa26.37■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.37■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 EPS15P42566 896 aa26.36■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.36■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
ELL3-202ENST00000433927 LTBP1Q14766 1721 aa26.35■■□□□ 1.81
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