RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm8a	Q9CWZ3	174 aa		33.44	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sipa1l3	G3X9J0	1776 aa		33.44	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	AK157302	I3ITR1	129 aa		33.44	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Isca1	Q9D924	129 aa		33.44	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ak2	Q9WTP6	239 aa		33.44	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prl3d3	A0A0M6L0J6	224 aa		33.43	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Abra	Q8BUZ1	375 aa		33.43	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Glipr1l2	Q9CQ35	332 aa		33.43	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Neurod6	P48986	337 aa		33.43	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pogk	Q80TC5	607 aa		33.43	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dmrt2	Q8BG36	561 aa		33.43	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355		Q9D9S1	216 aa		33.43	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Abca3	Q8R420	1704 aa		33.42	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dis3l2	Q8CI75	870 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snrk	Q8VDU5	748 aa		33.42	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Phax	Q9JJT9	385 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mecom	P14404	1042 aa		33.41	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Jarid2	Q62315	1234 aa		33.41	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pof1b	Q8K4L4	587 aa		33.41	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nav1	Q8CH77	1875 aa		33.41	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbm27	Q5SFM8	1060 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Smc4	Q8CG47	1286 aa		33.4	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mst1r	Q62190	1378 aa		33.4	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	App	P12023	770 aa		33.4	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Akap11	E9Q777	1895 aa		33.39	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyb5rl	B1AS42	316 aa		33.39	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sult6b1	P0CC03	303 aa		33.39	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mdm2	P23804	489 aa		33.39	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Syt1	P46096	421 aa		33.39	■■■□□ 2.94
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rnf20	Q5DTM8	973 aa		33.38	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dhx38	Q80X98	1228 aa		33.38	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rbbp8nl	A2ABX0	614 aa		33.38	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myd88	P22366	296 aa		33.38	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kif20a	P97329	887 aa		33.38	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm12185	Q5NCB2	835 aa		33.38	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prl3d2	F6R3P9	224 aa		33.37	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atf7	Q8R0S1	413 aa		33.37	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ltb4r2	Q9JJL9	360 aa		33.37	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Psma5	Q9Z2U1	241 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nfkbib	Q60778	359 aa		33.36	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sos2	Q02384	1333 aa		33.35	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cpa2	Q504N0	417 aa		33.35	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccnl1	Q52KE7	532 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmc2	Q8R4P4	888 aa		33.35	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam213a	Q9CYH2	218 aa		33.35	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zeb2	Q9R0G7	1215 aa		33.35	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Smc3	Q9CW03	1217 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hmg20b	Q9Z104	317 aa		33.34	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cdca7l	Q922M5	438 aa		33.33	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kcnh4	A2A5F7	1018 aa		33.33	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Smg7	Q5RJH6	1138 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rubcnl	Q3TD16	648 aa		33.32	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Atg9a	Q68FE2	551 aa		33.32	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrat	Q9JI60	231 aa		33.32	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tnrc6c	Q3UHC0	1690 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gnl3l	Q6PGG6	577 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fam102b	Q8BQS4	339 aa		33.31	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Arap2	Q8BZ05	1703 aa		33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vsig10	D3YX43	558 aa		33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nek11	Q8C0Q4	628 aa		33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Strbp	Q91WM1	672 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bmp2k	Q91Z96	1138 aa		33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	4931400O07Rik	Q9D4M5	137 aa		33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ugt1a5	B2RT14	529 aa		33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Apobr	Q8VBT6	942 aa		33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cap2	Q9CYT6	476 aa		33.3	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slk	O54988	1233 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gadd45b	P22339	160 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Smim5	Q8BT42	78 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Polr3d	Q91WD1	398 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Stx6	Q9JKK1	255 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zfp804b	A0A0G2JGH6	1343 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm9992	B2RWK3	458 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Unc93a	Q710D3	458 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Vps54	Q5SPW0	977 aa		33.27	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ankib1	Q6ZPS6	1085 aa		33.27	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccar2	Q8VDP4	922 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ciao1	Q99KN2	339 aa		33.27	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	AU015836	B2RUM3	263 aa		33.27	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rrs1	Q9CYH6	365 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Eya2	O08575	532 aa		33.26	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mctp2	Q5RJH2	878 aa		33.26	■■■□□ 2.92
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kif4	P33174	1231 aa		33.25	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gsdma2	Q32M21	443 aa		33.25	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pkp1	P97350	728 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lrp6	O88572	1613 aa		33.25	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sp8	Q8BMJ8	486 aa		33.24	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rps6kb1	Q8BSK8	525 aa		33.24	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gigyf1	Q99MR1	1044 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Erc1	Q99MI1	1120 aa		33.24	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Chmp3	Q9CQ10	224 aa		33.24	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wdr93	Q402B2	695 aa		33.23	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	F2r	P30558	430 aa		33.22	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bms1	Q6PGF5	1284 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tmem266	Q8BZB3	538 aa		33.22	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tubb6	Q922F4	447 aa		33.22	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Casz1	Q9CWL2	1761 aa		33.22	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fbxl16	A2RT62	479 aa		33.22	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ddx46	Q569Z5	1032 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ptma	P26350	111 aa		33.21	■■■□□ 2.91

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