RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089950.10

Rabggtb-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Igflr1Q3U4N7 345 aa15.85■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 BcanQ61361 883 aa15.85■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 St5Q924W7 1134 aa15.85■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Col11a2Q64739 1736 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 AU019823E9PUQ3 292 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Eva1cP58659 440 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Prom2Q3UUY6 835 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Adora1Q60612 326 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cgnl1Q6AW69 1298 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Q8C5K5 320 aa15.84■□□□□ 0.13
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 AtrnQ9WU60 1428 aa15.83■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Aldh8a1Q8BH00 487 aa15.83■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 LifrP42703 1092 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Itga6Q61739 1091 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Strip1Q8C079 837 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cetn4Q8K4K1 168 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Casz1Q9CWL2 1761 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Myo3bQ1EG27 1305 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gpr150Q8BL07 427 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gcc1Q9D4H2 778 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Znf609Q8BZ47 1413 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cfap70D3YVL2 1141 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Aknad1E9Q8N6 675 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ciao1Q99KN2 339 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Abcc4E9Q236 1325 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sult6b1P0CC03 303 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 AppP12023 770 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mcm2P97310 904 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Znf692Q3U381 531 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ccdc27Q3V036 639 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Emilin1Q99K41 1017 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Armcx1Q9CX83 456 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gja10Q9WUS4 505 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Greb1lB9EJV3 1913 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Brpf1B2RRD7 1212 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ube4aE9Q735 1028 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Eya2O08575 532 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Slc38a10Q5I012 1090 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Zbtb3Q91X45 518 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Chmp3Q9CQ10 224 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Fbxo3Q9DC63 480 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Plekho1Q9JIY0 408 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Atp8a2P98200 1148 aa15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Kif2cQ922S8 721 aa15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Chmp5Q9D7S9 219 aa15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa15.77■□□□□ 0.12
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Myh1Q5SX40 1942 aa15.77■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm7347D3YYI9 267 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Speer4aF8VPX6 267 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 EappQ5BU09 281 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 FanclQ9CR14 375 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mctp2Q5RJH2 878 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tango6Q8C3S2 1079 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tmc2Q8R4P4 888 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Kcnn1Q9EQR3 537 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Atp6v0a2P15920 856 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ftl2P49945 183 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Plbd2Q3TCN2 594 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Atg9aQ68FE2 551 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Atg4aQ8C9S8 396 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dydc2Q9D3X8 139 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 UvssaQ9D479 717 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Slurp2P0DP59 97 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gpr182P43142 395 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rps8P62242 208 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gsdma2Q32M21 443 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 EspnQ9ET47 871 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Adarb2Q9JI20 745 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Bin2D3Z6Q9 489 aa15.73■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1700029H14RikE9PY36 240 aa15.73■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Map7O88735 730 aa15.73■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 NfkbibQ60778 359 aa15.73■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Jarid2Q62315 1234 aa15.73■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Heg1E9Q7X6 1337 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Supt16hQ920B9 1047 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Naa16Q9DBB4 864 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.5 ms